50 份黄瓜核心种质的 SSR 标记筛选与聚类分析

【目的】分析 50 份来自全国各地的黄瓜核心种质资源的遗传多样性，为黄瓜育种提供依据和参考。【方法】对 50 份黄瓜核心种质资源的重要外观农艺性状进行统计，并利用全基因组设计 66 对 SSR 引物对其进行分子标记筛选及遗传多样性聚类分析。【结果】供试 50 份黄瓜核心种质材料的瓜皮颜色、刺瘤、瓜皮斑纹具有多样性。66 对引物中有 32 对引物能够在不同黄瓜种质间扩增出清晰而稳定的多态性标记，这 32 对 SSR 引物共扩增出 280 个等位基因片段，其中多态性片段 216 个、占片段总数的 77.1%，表明本研究筛选出的 32 对 SSR 引物遗传多态性较高，适用于黄瓜种质材料的遗传多样性分析。聚类结果与所调查的种质资源性状表现结果较为一致。50 份黄瓜核心种质遗传相似系数最低为 0.62、最高达 1.00。在遗传相似系数 0.754 处，50 份黄瓜种质材料聚为 7 类，即 9 份华南型材料聚为 6 类：I 类、III 类、IV 类、V 类、VI 类、VII 类，其中 IV 类包含 1 份中间材料与 9 号华南型材料；40 份华北型黄瓜材料聚为 1 类：II 类。表明华北型黄瓜材料和华南型黄瓜材料间相似系数低、亲缘关系远；华北型黄瓜材料间相似系数高、亲缘关系近、遗传背景窄、遗传多样性差；而华南型黄瓜材料间相似系数较低、亲缘关系较远、遗传背景宽、遗传多样性丰富。【结论】筛选出 32 对 SSR 引物可有效对 50 份黄瓜核心种质材料进行聚类分析，遗传相似系数为 0.754 处 50 份黄瓜材料聚为 7 类，其结果与性状调查结果相吻合；华北型黄瓜遗传背景窄、遗传多样性差，华南型黄瓜遗传背景相对较宽，遗传多样性丰富。

Screening of SSR Markers and Cluster Analysis in 50 Cucumber Core Germplasms