| 芸薹属AC 基因组MTP1 基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李施蒙.芸薹属AC 基因组MTP1 基因的生物信息学分析[J].广东农业科学,2018,45(9):21-27. |
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| 作者姓名： | 李施蒙 |
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| 作者单位： | 西藏自治区农牧科学院农业研究所 |
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| 基金项目： | 西藏自治区农牧科学院农业研究所青年基金（2017NKS-QNJJ） |
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| 摘 要： | 以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 MTP1 基因 重金属耐受蛋白 锌 CDF 家族 生物信息学 |
Bioinformatics analysis on MTP1 genes in the AC genomes of Brassicas |
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