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PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析
引用本文:曹宗喜,郑心力,张 艳,等.PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析[J].广东农业科学,2015,42(8):113-123.
作者姓名:曹宗喜  郑心力  张 艳  
作者单位:海南省农科院畜牧兽医研究所,海南海口,571100
基金项目:海南省自然科学基金,海南省农业科学院农业科技创新专项,海南省引进集成应用专项,海南省科学事业费项目
摘    要:为了研究猪圆环病毒2型(PCV2)海南株的分子特征,采用PCR方法从疑似PCV2感染的猪组织病料中扩增基因并进行序列分析.结果表明:8株PCV2海南株均属于PCV2b型,其中7株为PCV2b-1C亚型,1株为PCV2b-1A/1B亚型.PCV2海南株的ORF2基因的长度均为705 bp,编码234个氨基酸.Cap蛋白的抗原表位区发生了一定的变异.8个PCV2海南株的ORF2基因之间核苷酸序列相似性及推导的氨基酸序列相似性分别为95.3%~99.7%和93.6%~100%.海南株与国内分离株(AY682994,AF381175,JX945577,JX682407,AY180397)的核苷酸序列相似性为91.0%~99.9%,推导的氨基酸相似性为91.0%~99.6%.海南株与国外分离株(NC_005148,JQ994268,KJ187306,AF201307,AF454546,AY754020)的核苷酸序列相似性为90.0%~97.0%,推导的氨基酸相似性为88.0%~97.9%.海南株与疫苗株SH的核苷酸序列相似性为98.2%~100.0%,推导的氨基酸相似性为94.9%~100.0%.海南株与疫苗株LG的核苷酸序列相似性为90.6%~91.7%,推导的氨基酸相似性为89.7%~91.0%.这些数据为海南地区PCV2的防控和疫苗株选择提供了理论依据.

关 键 词:猪圆环病毒2型  全基因组  克隆  序列分析

Cloning and sequence analysis of complete genome ofporcine circovirus isolated from Hainan province
CAO Zong-xi,ZHENG Xin-li,ZHANG Yan,YE Bao-guo,LIN Zhe-min,WANG Feng.Cloning and sequence analysis of complete genome ofporcine circovirus isolated from Hainan province[J].Guangdong Agricultural Sciences,2015,42(8):113-123.
Authors:CAO Zong-xi  ZHENG Xin-li  ZHANG Yan  YE Bao-guo  LIN Zhe-min  WANG Feng
Abstract:
Keywords:
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