广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5 基因遗传变异分析

【目的】监测 2021 年广东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒 (Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus，PRRSV) 的分子流行动态，为 PRRSV 综合防控措施的制定提供参考。【方法】在广东省内不同 地区 PRRSV 检测为阳性的 37 个规模猪场采集 521 份患病猪组织样本进行 PRRSV 检测。对样本进行 ORF5 基因 测序，采用 DNAStar 分析 ORF5 核苷酸的同源性及其推导氨基酸的同源性，并用 Mega7.0 构建基于 ORF5 基因的 系统遗传进化树。【结果】从 37 个猪场采集的样品 PRRSV 阳性率为 24.4%，猪场阳性率为 45.9%。通过测序分 析获得 17 株来自不同猪场的 PRRSV ORF5 基因序列，遗传进化分析表明所有毒株均属于北美毒株（PRRSV 2）， 其中有 5 株属于 Lineage 8( JXA1-like 和 CH-1a-like）谱系，9 株属于 Lineage 1( NADC30-like 和 NADC34-like）谱系， 3 株属于 Lineage 3（QYYZ-like）谱系，没有监测到 Lineage 5（VR2332-like）谱系的毒株。17 株 PRRSV 毒株的 ORF5 基因之间核苷酸序列同源性为 81.3%~99.5%，推导的氨基酸序列同源性为 80.0%~98.3%。【结论】2021 年 广东省 PRRSV 流行株以 Lineage 1（NADC30-like 和 NADC34-like）和 Lineage 8（JXA1-like 和 CH-1a-like）谱 系为主，占比分别为 52.94% 和 29.41%，Lineage 3（QYYZ-like）谱系降为次要流行株，占比为 17.65%。

Genetic Variation Analysis of ORF5 Genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus in Guangdong Province