基于Cyt b序列分析黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代的遗传多样性 |
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引用本文: | 肖何威,胡亚洲,秦溱,徐大建,梁艺馨,刘小燕,王晓清.基于Cyt b序列分析黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代的遗传多样性[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2023,49(4):486-490. |
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作者姓名: | 肖何威 胡亚洲 秦溱 徐大建 梁艺馨 刘小燕 王晓清 |
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作者单位: | 湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2018YFD0900200);湖南省水产产业技术体系 |
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摘 要: | 为了解中华鳖(Pelodiscus sinensis)中黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代的遗传特性,分别对它们的线粒体Cytb基因测序,并进行遗传多样性分析。结果表明:PCR扩增测序黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代3个群体共获得90条序列,18种单倍型;90个个体的Cytb基因碱基A、T、C、G平均含量分别为35.4%、26.0%、27.9%、10.7%,表现出明显的反G偏倚;日本鳖、黄沙鳖和杂交鳖分别有5、6、10种单倍型,日本鳖与杂交子代有共享的单倍型Hap 8、Hap 9和Hap 16;3个群体的变异主要存在于群体内部,变异比例为60.8%;3个群体的单倍型多样性为0.747~0.867,平均核苷酸差异数为12.922~16.262,核苷酸多样性为0.00913~0.01151;杂交子一代的单倍型数、单倍型多样性、平均核苷酸差异数、核苷酸多样性均最高,日本鳖的均最低,黄沙鳖、杂交子一代、日本鳖的多态位点数依次降低。可见,杂交子代遗传多样性较高,杂交可提高中华鳖的遗传多样性。
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关 键 词: | 黄沙鳖 日本鳖 Cyt b基因 遗传多样性 单倍型 多态位点 |
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