猪PKM2基因的序列分析与组织表达及亚细胞定位 |
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引用本文: | 赵为民,涂枫,方晓敏,王学敏,付言峰,李碧侠,周李生,任守文.猪PKM2基因的序列分析与组织表达及亚细胞定位[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2019,45(1). |
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作者姓名: | 赵为民 涂枫 方晓敏 王学敏 付言峰 李碧侠 周李生 任守文 |
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作者单位: | 江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京 210014;农业部种养结合重点实验室,江苏南京 210014;江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京 210014;农业部种养结合重点实验室,江苏南京 210014;江苏省农业种质资源保护与利用平台,江苏南京 210014 |
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基金项目: | 国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站(CARS–35);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(17)2002);江苏省农业科学院基本科研业务专项(ZX(15)4002) |
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摘 要: | 运用RT–PCR技术克隆猪PKM2基因的编码区序列,对该序列进行生物信息学分析,研究PKM2基因的组织表达及亚细胞定位。结果显示:猪PKM2基因CDS全长1 596 bp,编码531个氨基酸;预测其蛋白相对分子质量为5.79×104,等电点为7.96,含有多个磷酸化位点,为稳定蛋白;PKM2蛋白含有丙酮酸激酶家族的barreldomain和alpha/beta domain 2个结构域,其蛋白二级结构中α–螺旋和无规则卷曲占主要类型;猪PKM2蛋白序列在物种间非常保守,系统进化树分析表明,该蛋白与兔的亲缘关系最近;组织表达显示,猪PKM2基因在肾、小肠中相对高表达,而在肝脏与肌肉中相对低表达;亚细胞定位显示,PKM2蛋白在猪3D4/21和PK15细胞中表达于细胞质,而不表达于细胞核。
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关 键 词: | 猪 PKM2基因 序列分析 组织表达 亚细胞定位 |
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