银杏ERF转录因子家族的全基因组学鉴定及表达模式分析 |
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引用本文: | 张斌,唐满生.银杏ERF转录因子家族的全基因组学鉴定及表达模式分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2020,46(5):519-526. |
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作者姓名: | 张斌 唐满生 |
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作者单位: | 湖南科技学院化学与生物工程学院,湖南 永州 425199;湖南省银杏工程技术研究中心,湖南 永州 425199 |
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基金项目: | 湖南省自然科学基金(2019JJ50201);湖南科技学院重点项目(17XKY012) |
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摘 要: | 以银杏基因组数据库为基础,通过序列比对,并经过鉴定筛选,共获得112个ERF转录因子家族成员,对其进行生物信息学及表达模式分析。结果显示:银杏112个ERF成员在系统进化树上分为10个亚家族;基因结构分析表明,大部分ERF家族基因结构简单,仅少量基因含有1~4个内含子;基因表达分析显示,39个ERF基因在雄蕊中表达量较高,20个基因在幼苗中表达量较高,40个基因在胚中表达量较高;部分基因在雄蕊、胚和幼苗中具有相同的表达模式,说明其可能具有类似的功能。
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关 键 词: | 银杏 ERF基因家族 生物信息学 基因结构 基因表达 |
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