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水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析
引用本文:姜兆远,任金平,刘晓梅,邹晓威,郭晓莉,王继春,温嘉伟,刘文平,夏海丰,洪德志.水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析[J].中国农业科学,2013,46(24):5123-5131.
作者姓名:姜兆远  任金平  刘晓梅  邹晓威  郭晓莉  王继春  温嘉伟  刘文平  夏海丰  洪德志
基金项目:吉林省科技厅重大专项(2060901)、吉林省博士后基金(01920)
摘    要:【目的】分析水稻接种稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)48 h后亲和互作与非亲和互作反应的基因表达谱,探索水稻对不同稻瘟病菌抗性差异的分子机理。【方法】运用Affymetrix表达谱芯片分析差异表达mRNA;通过分子注释系统平台(MAS 3.0)对差异表达基因进行了基因注释及GO分析;应用实时定量PCR 对部分差异表达基因进行验证。【结果】在49 824个转录本中共检测到大约24 000个转录本,Fold change大于2.5的基因共1 028个,其中非亲和互作上调基因460个,下调基因568个。所验证的4个基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致。经GO分析差异基因对应蛋白的功能主要涉及信号转导、酶的调节、转录及分子转运等。【结论】水稻与稻瘟病菌非亲和与亲和互作的基因表达谱存在较大差异,基因芯片筛选到的差异表达基因通过GO注释明确了差异基因的分子功能及信号通路,有利于进一步了解植物抗病机制,并可能为稻瘟病防治措施提供新的途径。

关 键 词:稻瘟病    基因表达谱    基因芯片
收稿时间:2013-06-05

Comparative Analysis of Gene Expression Profiles of Rice Responding to Different Races of Magnaporthe grisea
JIANG Zhao-Yuan-,REN Jin-Ping-,LIU Xiao-Mei-,ZOU Xiao-Wei-,GUO Xiao-Li-,WANG Ji-Chun-,WEN Jia-Wei-,LIU Wen-Ping-,XIA Hai-Feng-,HONG De-Zhi-.Comparative Analysis of Gene Expression Profiles of Rice Responding to Different Races of Magnaporthe grisea[J].Scientia Agricultura Sinica,2013,46(24):5123-5131.
Authors:JIANG Zhao-Yuan-  REN Jin-Ping-  LIU Xiao-Mei-  ZOU Xiao-Wei-  GUO Xiao-Li-  WANG Ji-Chun-  WEN Jia-Wei-  LIU Wen-Ping-  XIA Hai-Feng-  HONG De-Zhi-
Institution:1.Northeast Agricultural Research Center of China, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Changchun 130033; 2.Institute of Plant Protection, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Gongzhuling 136100, Jilin; 3.Key Laboratory of Integrated Pest Management on Crops in Northeast, Ministry of Agriculture, Gongzhuling136100, Jilin; 4.Tonghua Academy of Agricultural Sciences, Tonghua 135007, Jilin;5.Agricultural Technology and Extension Center of Jilin Province, Changchun 130021
Abstract:
Keywords:rice blast  gene expression profile  genechip
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