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玉米大斑病菌转录因子StSte12的表达特性分析及其调控基因的筛选
引用本文:张长志,李坡,谷守芹,巩校东,杨阳,范钰,田兰,张晓玉,韩建民,董金皋.玉米大斑病菌转录因子StSte12的表达特性分析及其调控基因的筛选[J].中国农业科学,2013,46(8):1603-1609.
作者姓名:张长志  李坡  谷守芹  巩校东  杨阳  范钰  田兰  张晓玉  韩建民  董金皋
作者单位:1.河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室,河北保定 071001
2.河北省农林科学院植物保护研究所,河北保定 071000
基金项目:国家自然科学基金(30471126)、河北省自然科学基金(C2012204033)
摘    要:【目的】确定玉米大斑病菌转录因子StSte12在基因组中的位置,分析目的蛋白质StSte12的结构特征;明确StSTE12在病菌不同发育时期的表达情况;筛选可能受StSte12转录因子调控的基因,分析其匹配序列的结构特征,并比较它们在病菌的中表达情况。【方法】利用生物信息学方法,确定StSte12在玉米大斑病菌基因组中的位置并解析目的蛋白质StSte12的结构特征;利用Western blot技术分析StSTE12在病菌不同发育时期的表达规律;根据酿酒酵母Ste12转录因子的下游调控基因,筛选病菌中可能受StSte12调控的功能基因;并利用生物信息学方法得出下游调控基因的结合位点;利用RT-PCR技术,分析这些基因在StSTE12 RNAi转化子与野生型菌株中的表达情况。【结果】StSTE12的 ID为105656,该基因位于scaffold_13正链的1061747-1064127位置;该蛋白具有Ste12-like蛋白特有的保守结构域(STE homeodomain和ZnF_C2H2锌指结构)及空间结构;StSTE12在附着胞时期表达量最大;筛选了部分StSte12调控基因,与StSte12的匹配序列为T\C GAAAC A\G,中间部分GAAAC非常保守;StKAR5在野生型中表达量小于StSTE12 RNAi转化子,StBEM2、StBUD8、StCHS7相反;StRAX2的表达量在野生型和转化子中一致。【结论】StSte12具有Ste12-like所特有的DNA结合结构域和空间结构;该蛋白在附着胞发育中发挥重要功能;筛选了部分StSte12的调控基因,其匹配序列可概括为T\C GAAAC A\G,且证实了这些基因受StSte12调控。

关 键 词:玉米大斑病菌    转录因子    StSte12    调控基因
收稿时间:2012-12-24

StSte12 Expression Characteristics and Preliminary Screening of Its Regulatory Genes in Setosphaeria turcica
ZHANG Chang-Zhi,LI Po,GU Shou-Qin,GONG Xiao-Dong,YANG Yang,FAN Yu,TIAN Lan,ZHANG Xiao-Yu,HAN Jian-Min,DONG Jin-Gao.StSte12 Expression Characteristics and Preliminary Screening of Its Regulatory Genes in Setosphaeria turcica[J].Scientia Agricultura Sinica,2013,46(8):1603-1609.
Authors:ZHANG Chang-Zhi  LI Po  GU Shou-Qin  GONG Xiao-Dong  YANG Yang  FAN Yu  TIAN Lan  ZHANG Xiao-Yu  HAN Jian-Min  DONG Jin-Gao
Institution:1.Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Agricultural University of Hebei, Baoding 071000, Hebei; 2.Plant Protection Institute, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Baoding 071000, Hebei
Abstract:
Keywords:
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