| 梨遗传连锁图谱的构建与比较分析 |
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| 引用本文： | 王磊,王龙,薛华柏,李秀根,李疆.梨遗传连锁图谱的构建与比较分析[J].中国农业科学,2016,49(12):2353-2367. |
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| 作者姓名： | 王磊 王龙 薛华柏 李秀根 李疆 |
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| 基金项目： | 国家“十二五”科技支撑计划（2013BAD02B01）、中国农业科学院创新工程（CAAS-ASTIP） |
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| 摘 要： | 【目的】利用已公开发表的梨和苹果的SSR(Simple Sequence Repeat)引物以及从梨转录组开发的SSR引物构建本研究作图群体的遗传连锁图谱,为后期梨重要性状QTL定位和分子标记辅助选择等奠定基础。【方法】以西洋梨品种‘红茄’(Red Clapp Favorite)为母本,东方梨品种‘晚秀’(Mansoo)为父本,构建F1代作图群体。将所选用的SSR引物在亲本和4个子代个体进行PCR扩增,初步筛选出扩增结果符合Join Map 4.0软件中"CP"作图模式要求的引物,随后在F1群体中检测,选用Join Map 4.0软件对分离数据进行连锁分析,分别构建亲本的连锁图谱。以双亲图谱在各连锁群上的同源标记作为锚定位点,对双亲图谱进行整合。【结果】利用PCR技术对不同来源的共909对SSR引物(526对梨和283对苹果公开发表的SSR引物,从梨转录组开发的100对SSR引物)进行初步筛选后,发现来自苹果的SSR引物有效扩增片段的比例和多态性均较低,而来自梨和梨转录组开发的SSR引物相对较高。筛选出207对符合作图要求的SSR引物在群体中扩增,构建亲本的连锁图谱。母本图谱中的141个标记分布在17个连锁群上,总长度757.34 c M,标记间平均5.37 c M;父本图谱中的153个标记分布在19个连锁群上,总长度1 149.43 c M,标记间平均7.51 c M。【结论】对不同来源的SSR引物构建的双亲连锁图谱进行整合,最终得到一张由186个SSR标记,覆盖基因组长度1 125.33 c M的整合图谱。
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| 关 键 词： | 梨 SSR 连锁图谱 整合图谱 |
| 收稿时间： | 2015-12-28 |
Construction of SSR Genetic Linkage Map and Comparison on Pears |
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| WANG Lei,WANG Long,XUE Hua-bai,LI Xiu-gen,LI Jiang.Construction of SSR Genetic Linkage Map and Comparison on Pears[J].Scientia Agricultura Sinica,2016,49(12):2353-2367. |
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| Authors: | WANG Lei WANG Long XUE Hua-bai LI Xiu-gen LI Jiang |
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| Institution: | 1.College of Horticulture & Forestry Sciences, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052;2.Zhengzhou Fruit Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou 450009 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pear SSR genetic linkage map integrated the genetic map |
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