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大豆孢囊线虫果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5的克隆与分析
引用本文:彭焕,彭德良,黄文坤,贺文婷,胡先奇.大豆孢囊线虫果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5的克隆与分析[J].中国农业科学,2012,45(5):854-866.
作者姓名:彭焕  彭德良  黄文坤  贺文婷  胡先奇
作者单位:1.云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程研究中心,昆明 650201; 2.中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京 100193
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(200903040)
摘    要:【目的】克隆和分析与大豆孢囊线虫寄生密切相关的果胶酸裂解酶新基因,为研究大豆孢囊线虫寄生和致病的分子机理提供依据,并为探讨大豆孢囊线虫的防控新途径提供理论基础。【方法】通过EST分析结合RACE-PCR扩增方法,从大豆孢囊线虫中克隆出1个果胶酸裂解酶新基因;通过原位杂交和半定量PCR的方法确定基因的表达部位和分析不同发育阶段的基因表达;采用Southern杂交方法分析基因的拷贝数。【结果】 从大豆孢囊线虫中克隆出1个全长为957个碱基编码227个氨基酸残基的新果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5(GenBank 登录号HQ123259)。Hg-pel-5 基因组由2个外显子和1个内含子组成。预测蛋白含有20个氨基酸残基的信号肽和4段细菌结构的果胶酸裂解酶第三家族的保守位点。原位杂交确定Hg-pel-5在大豆孢囊线虫亚腹食道腺中表达。半定量RT-PCR结果表明Hg-pel-5在寄生前和寄生过程早期的2龄幼虫大量表达。Southern杂交结果显示Hg-pel-5存在于大豆孢囊线虫基因组中并以多拷贝形式存在。【结论】对大豆孢囊线虫中1个新的果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5进行克隆和分析,表明该基因在大豆孢囊线虫早期寄生过程中发挥重要作用。

关 键 词:大豆孢囊线虫  果胶酸裂解酶  基因克隆  原位杂交  Southern  杂交
收稿时间:2011-11-03

Molecular Cloning and Analysis of a Novel Pectate Lyase Gene Hg-pel-5 from Soybean Cyst Nematode
PENG Huan , PENG De-liang , HUANG Wen-kun , HE Wen-ting , HU Xian-qi.Molecular Cloning and Analysis of a Novel Pectate Lyase Gene Hg-pel-5 from Soybean Cyst Nematode[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(5):854-866.
Authors:PENG Huan  PENG De-liang  HUANG Wen-kun  HE Wen-ting  HU Xian-qi
Institution:1(1The National Engineering Research Center of Agribiodiversity Applied Technologies,Yunnan Agricultural University,Kunming 650201;2State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests,Institute of Plant Protection,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193)
Abstract:
Keywords:Heterodera glycines  pectate lyase  gene cloning  in situ hybridization  Southern blot
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