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小麦抗旱相关基因TaCRT-D单核苷酸多态性分析
引用本文:王计平,毛新国,景蕊莲,李润植,昌小平.小麦抗旱相关基因TaCRT-D单核苷酸多态性分析[J].中国农业科学,2008,41(12):3983-3990.
作者姓名:王计平  毛新国  景蕊莲  李润植  昌小平
作者单位:山西农业大学农学院
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)  
摘    要: 【目的】钙网蛋白(CRT)是细胞内质网膜上的钙结合蛋白,参与多种细胞功能的调节。研究小麦钙网蛋白基因TaCRT-D单核苷酸多态性,并分析其与抗旱性的关系。【方法】以苗期抗旱性不同的37份六倍体普通小麦和3份普通小麦D基因组供体种粗山羊草为材料,通过直接测序分析TaCRT-D基因的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系。【结果】TaCRT-D基因DNA长度为4 001 bp,在长达160 040 bp的核苷酸序列中共检测到105个单核苷酸变异位点,包括84个SNP和21个InDel,二者出现的频率分别为1/1 905和1/7 621,编码区的核苷酸多样性值(π)小于非编码区,说明编码区所承受的选择压力较大,遗传变异小于非编码区。单倍型分析表明,40份供试材料分为8种单倍型,其中单倍型H1中11份材料包括4份中等抗旱材料和7份干旱敏感材料;单倍型H3、H4和H7既有抗旱性强的材料也有干旱敏感材料;单倍型H5只包括3份小麦D基因组供体种材料。【结论】普通小麦TaCRT-D基因中SNP频率较低,TaCRT-D基因单核苷酸多态性与小麦苗期抗旱性之间没有明显的对应关系。

关 键 词:小麦  TaCRT-D基因  单核苷酸多态性  单倍型  抗旱性
收稿时间:2008-1-16

Single Nucleotide Polymorphism of TaCRT-D Gene Associated with Drought Resistance in Wheat Germplasm
WANG Ji-ping,MAO Xin-guo,JING Rui-lian,LI Run-zhi,CHANG Xiao-ping.Single Nucleotide Polymorphism of TaCRT-D Gene Associated with Drought Resistance in Wheat Germplasm[J].Scientia Agricultura Sinica,2008,41(12):3983-3990.
Authors:WANG Ji-ping    MAO Xin-guo  JING Rui-lian  LI Run-zhi  CHANG Xiao-ping
Institution:WANG Ji-ping1,2,MAO Xin-guo2,JING Rui-lian2,LI Run-zhi1,CHANG Xiao-ping2
Abstract:
Keywords:Wheat  TaCRT-D gene  Single nucleotide polymorphism  Haplotype  Drought resistance
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