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中国马铃薯Y病毒的检测鉴定及CP基因的分子变异
引用本文:高芳銮,沈建国,史凤阳,方治国,谢联辉,詹家绥.中国马铃薯Y病毒的检测鉴定及CP基因的分子变异[J].中国农业科学,2013,46(15):3125-3133.
作者姓名:高芳銮  沈建国  史凤阳  方治国  谢联辉  詹家绥
基金项目:国家现代农业马铃薯产业技术体系(CARS-10)、福建省自然科学基金项目(2013J01088)、福建省教育厅科技项目(JA12119)、福建出入境检验检疫局科技项目(FK2011-07)
摘    要:【目的】查明马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)病在中国的发生情况,及时、准确地鉴定出PVY并对其分子变异进行分析。【方法】采用ELISA 方法对采自中国14个省(直辖市)马铃薯种植区疑似受PVY感染的样品进行了检测,并对其中的部分材料镜检验证,然后根据CP基因序列设计1对简并引物针对随机选择感染PVY的14个省(直辖市)代表样品进行CP基因扩增克隆,将测序得到的序列进行分子变异分析,并使用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)重建系统发育关系。【结果】ELISA检测结果表明,691份样品中220个样品与PVY抗体呈阳性反应,其余呈阴性反应;ELISA检测的阳性材料在透射电镜下均可观察到明显的风轮状内含体,14个PVY分离物均成功扩增出预期大小(约800 bp)的特异性片段,CP基因的核苷酸序列与已报道PVY不同株系的核苷酸序列一致性均在88%以上;在14个PVY分离物CP基因中共发现有29个多态性位点,其中6个简约信息位点,23个单一变异位点。系统发育分析结果显示,14个PVY分离物与PVYN:O株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上,与PVYN:O株系的亲缘关系最近。【结论】PVY CP基因高度保守,但不同地区分离物也存在一定的分子变异,本研究可为今后了解PVY病毒病流行、变异趋势及其防治提供依据。

关 键 词:马铃薯Y病毒    ELISA    外壳蛋白基因    分子变异    贝叶斯法
收稿时间:2013-01-25

Detection and Molecular Variation of Potato virus Y CP Gene in China
GAO Fang-Luan-,SHEN Jian-Guo-,SHI Feng-Yang-,FANG Zhi-Guo-,XIE Lian-Hui-,ZHAN Jia-Sui-.Detection and Molecular Variation of Potato virus Y CP Gene in China[J].Scientia Agricultura Sinica,2013,46(15):3125-3133.
Authors:GAO Fang-Luan-  SHEN Jian-Guo-  SHI Feng-Yang-  FANG Zhi-Guo-  XIE Lian-Hui-  ZHAN Jia-Sui-
Institution:1.Key Laboratory of Plant Virology of Fujian Province, Institute of Plant Virology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002; 2.Inspection & Quarantine Technology Center, Fujian Exit-Entry Inspection and Quarantine Bureau, Fuzhou 350001
Abstract:
Keywords:Potato virus Y  ELISA  coat protein gene (CP gene)  molecular variation  Bayesian inference method
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