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白菜叶缘裂刻近等基因系的cDNA-AFLP分析及SCAR标记的转化
引用本文:惠麦侠,王晗,张鲁刚,何玉科.白菜叶缘裂刻近等基因系的cDNA-AFLP分析及SCAR标记的转化[J].中国农业科学,2010,43(21).
作者姓名:惠麦侠  王晗  张鲁刚  何玉科
作者单位:(西北农林科技大学园艺学院/农业部西北园艺植物种质资源利用重点开放实验室)
基金项目:西北农林科技大学青年学术骨干项目,"十一五"国家高技术研究发展计划,国家自然科学基金重点基金
摘    要:【目的】寻找与白菜叶缘裂刻发育相关的表达基因,了解叶缘裂刻调控的分子机理。【方法】应用cDNA-AFLP技术从mRNA表达水平研究白菜叶全缘和裂刻近等基因系间基因表达的差异。【结果】共获得57条差异片段,合并归属于55条非重复序列,其中在叶全缘株系中增强或特异表达的有25条,叶裂刻株系中增强或特异表达的有30条。54条差异片段可以在NCBI数据库中找到同源序列(包括EST)、其中42条为已知基因,1条没有找到同源序列。按照其参与的生物学途径归类,已知基因片段参与了代谢、转录、细胞囊泡运输、蛋白质合成和降解、蛋白质储藏与运输、信号传导、光合系统、基因转座等相关过程。用AFLP转化的SCAR标记在分离群体上验证结果表明,SEL7B16-SCAR检测片段的表达模式与cDNA-AFLP结果一致。【结论】构建了白菜叶缘裂刻发育调控基因表达谱,识别了与已知NAC036、DP-2、MYB77、TCP24参与调控裂刻发生基因密切相关的片段。基于cDNA-AFLP特异序列,开发了1条与裂刻紧密连锁的SCAR标记,命名为SEL7B16-SCAR,可用于裂叶纯合和杂合的分子辅助选择。

关 键 词:白菜  叶缘裂刻  cDNA-AFLP  差异表达  SCAR  标记
收稿时间:2010-07-20;

cDNA-AFLP Analysis and Conversion of SCAR Markers of Near-Isogenic Lines with Lobed Leaves from No-Heading Chinese Cabbage(Brassica rapa ssp.cheninsis)
HUI Mai-xia,WANG Han,ZHANG Lu-gang,HE Yu-ke.cDNA-AFLP Analysis and Conversion of SCAR Markers of Near-Isogenic Lines with Lobed Leaves from No-Heading Chinese Cabbage(Brassica rapa ssp.cheninsis)[J].Scientia Agricultura Sinica,2010,43(21).
Authors:HUI Mai-xia  WANG Han  ZHANG Lu-gang  HE Yu-ke
Institution:(College of Horticulture, Northwest A &; F University/Key Laboratory of Horticulture Plant Germplasm Resource Utilization in Northwest China, Ministry of Agriculture)
Abstract:
Keywords:no-heading Chinese cabbage  lobed leaves  cDNA-AFLP  differential expression  SCAR marker
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