用等位基因特异POR检测普通小麦(Triticum aestivum L.)的单核苷酸多态性单核苷酸多态性 |
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引用本文: | 卫波,景蕊莲,王成社,昌小平.用等位基因特异POR检测普通小麦(Triticum aestivum L.)的单核苷酸多态性单核苷酸多态性[J].中国农业科学,2006,39(7):1313-1320. |
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作者姓名: | 卫波 景蕊莲 王成社 昌小平 |
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作者单位: | [1]西北农林科技大学农学院,杨凌712100 [2]国家基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 |
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基金项目: | 国家“863”计划项目(编号:2004AA211102)资助 |
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摘 要: | 【目的】以2份六倍体小麦Opata85和W7984及其重组近交系(RIL)的111个株系和3份小麦二倍体野生近缘种为材料,研究用等位基因特异PCR检测普通小麦中单核苷酸多态性的方法。【方法】利用直接测序的方法检测2份六倍体小麦和3份小麦二倍体野生近缘种TaDREB1基因的DNA序列,在B基因组上发现了2个SNPs。以其为3’端,设计等位基因特异引物及其互补引物,对SNP进行分型,同时研究了特异引物3’端碱基错配对等位基因特异PCR的影响,优化了PCR反应体系。【结果】等位基因特异引物3’端不同位置的碱基错配及不同类型的碱基错配对PCR结果影响较大;在等位基因特异PCR中,Mg^2+、dNTP及TaqDNA聚合酶的用量均大于普通PCR。【结论】只要在等位基因特异引物3’端加上合适的错配碱基,并且优化其PCR反应体系,用等位基因特异PCR方法检测六倍体小麦中的单核苷酸多态性是可行的。
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关 键 词: | 六倍体小麦 单核苷酸多态性 等位基因特异PCR 碱基错配 |
收稿时间: | 2005-09-21 |
修稿时间: | 2005-09-212006-05-10 |
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