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巴西橡胶树橡胶粒子蛋白质的16-BAC/SDS-PAGE双向电泳及质谱分析
引用本文:代龙军,项秋兰,黎瑜,聂智毅,康桂娟,段翠芳,曾日中.巴西橡胶树橡胶粒子蛋白质的16-BAC/SDS-PAGE双向电泳及质谱分析[J].中国农业科学,2012,45(11):2328-2338.
作者姓名:代龙军  项秋兰  黎瑜  聂智毅  康桂娟  段翠芳  曾日中
作者单位:中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地,海南儋州 571737
基金项目:国家自然科学基金项目,中央级公益性科研院所基本科研业务费项目
摘    要:【目的】分析巴西橡胶树(Hevea Brasiliensis Müll.Arg.)橡胶粒子的蛋白质构成,探索未知的橡胶粒子蛋白质。【方法】采用16-BAC/SDS PAGE双向电泳分离橡胶粒子蛋白质,采用MALDI/TOF-TOF质谱技术进行蛋白质鉴定;此外,利用磺基异硫氰酸苯酯(SPITC)化学辅助质谱测序法进行肽段的从头测序,获得未知蛋白质肽段的氨基酸序列。通过搜索橡胶树胶乳转录组测序获得的EST数据库,获取已知部分氨基酸序列蛋白质的全序列,或通过部分肽段获取为未知蛋白质编码的EST序列。【结果】获得了橡胶粒子蛋白质的16-BAC/SDS-PAGE双向电泳图谱,鉴定了17个橡胶粒子蛋白质;获得1个小橡胶粒子蛋白(small rubber particle protein,SRPP)亚家族成员SRPP(gi|37622210)的完整氨基酸序列以及1个橡胶延伸因子(rubber elongation factor,REF)亚家族新成员(hbREF2)的C端87个氨基酸残基序列,此蛋白质的氨基酸序列与已知的REF(gi|38122474)具有高度的相似性。【结论】采用16-BAC/SDS-PAGE双向电泳有效地分离了橡胶粒子蛋白质,展现了橡胶粒子蛋白质的相对含量,研究结果表明构成橡胶粒子的主要蛋白质组分是REF和SRPP亚家族蛋白质。橡胶粒子的蛋白质组分的全面鉴定,将有助于揭示橡胶粒子的生物学功能。

关 键 词:巴西橡胶树  橡胶粒子  蛋白质  16-BAC/SDS-PAGE双向电泳  质谱分析
收稿时间:2011-12-28

Rubber Particle Protein Analysis of Hevea brasiliensis by Two Dimensional 16-BAC/SDS-PAGE and Mass Spectrometry
DAI Long-jun , XIANG Qiu-lan , LI Yu , NIE Zhi-yi , KANG Gui-juan , DUAN Cui-fang , ZENG Ri-zhong.Rubber Particle Protein Analysis of Hevea brasiliensis by Two Dimensional 16-BAC/SDS-PAGE and Mass Spectrometry[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(11):2328-2338.
Authors:DAI Long-jun  XIANG Qiu-lan  LI Yu  NIE Zhi-yi  KANG Gui-juan  DUAN Cui-fang  ZENG Ri-zhong
Institution:(Rubber Research Institute,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences(CATAS)/Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Rubber Tree,Ministry of Agriculture/State Key Laboratory Incubation Base,Danzhou 571737,Hainan)
Abstract:
Keywords:Hevea brasiliensis  rubber particle  protein  16-BAC/SDS-PAGE two dimensional electrophoresis  mass spectrometry
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