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大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选
引用本文:郭刚刚,董国清,周进,达瓦顿珠,袁兴淼,张京.大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选[J].中国农业科学,2013,46(1):9-17.
作者姓名:郭刚刚  董国清  周进  达瓦顿珠  袁兴淼  张京
作者单位:中国农业科学院作物科学研究所/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程;武汉工业学院;西藏农牧科学院
基金项目:国家“863”计划项目(2012AA101105-4);国家“十二五”科技支撑计划(2012BAD03B01-2);国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-05)
摘    要:【目的】从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆。【方法】构建BAC文库三维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析。【结果】构建了大麦BAC文库的三维混合池160个,文库空载率为0.18%;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类型的反转录转座子插入,从而使大麦比其它作物的GW2长度增加11.5 kb以上。【结论】通过构建三维混合池快速筛选包含目的基因的单个阳性BAC克隆,建立了大麦目标基因克隆的辅助平台;HvGW2基因组中位于内含子区的反转录转座子插入导致基因长度增加,可能是影响该基因转录水平的关键变异。

关 键 词:大麦    BAC文库    三维混合池    HvGW2    粒重基因
收稿时间:2012-10-12

Three-Dimensional Pooling and HvGW2 Gene Screening of Barley (Hordeum vulgare L.) BAC Library
GUO Gang-gang,DONG Guo-qing,ZHOU Jin,DAWAdunzhu,YUAN Xing-miao,ZHANG Jing.Three-Dimensional Pooling and HvGW2 Gene Screening of Barley (Hordeum vulgare L.) BAC Library[J].Scientia Agricultura Sinica,2013,46(1):9-17.
Authors:GUO Gang-gang  DONG Guo-qing  ZHOU Jin  DAWAdunzhu  YUAN Xing-miao  ZHANG Jing
Institution:1.Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Crop Germplasm and Biotechnology, Ministry of Agriculture/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Beijing 100081; 2.Wuhan Polytechnic University, Wuhan 430023; 3.Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences, Lhasa 850032
Abstract:
Keywords:barley  BAC library  three-dimensional pools  HvGW2  grain weight gene
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