首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

棉花抗细胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表达分析
引用本文:龚文芳,喻树迅,宋美珍,范术丽,庞朝友,肖水平.棉花抗细胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表达分析[J].中国农业科学,2010,43(18):3713-3723.
作者姓名:龚文芳  喻树迅  宋美珍  范术丽  庞朝友  肖水平
作者单位:(中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点实验室);
基金项目:国家"863"计划项目 
摘    要:【目的】克隆陆地棉抗细胞凋亡新基因GhDAD1,为陆地棉细胞凋亡的分子机制提供依据,为培育不早衰陆地棉品种提供理论基础。【方法】采用RT-PCR以及电子克隆获得陆地棉GhDAD1的基因组序列以及全长cDNA序列并进行生物信息学分析,然后通过荧光原位杂交(FISH)技术进行染色体定位,利用real-timePCR进行表达模式分析,分析6-BA、乙烯、H2O2、SA以及NO对GhDAD1表达量的影响。【结果】棉花GhDAD1编码阅读框全长354bp,包含5个外显子,4个内含子以及232bp的5′非编码区和280bp的3′非编码区。氨基酸序列分析表明,GhDAD1蛋白属于DAD家族,与柑桔、拟南芥GhDAD1蛋白的相似性分别为91%和88%,起始密码子区符合Kozark规则,内含子剪接位点符合GT-AG规则。FISH技术将GhDAD1定位于染色体长臂上。real-time PCR分析表明,陆地棉各组织中均表达该基因,花和种胚等幼嫩组织表达量较高,并且随着衰老的进行,表达量降低。利用6-BA、乙烯、水杨酸、一氧化碳以及双氧水处理中棉所10号,qRT-PCR分析表明,6-BA、水杨酸处理能够延缓衰老,增加GhDAD1的表达量;乙烯能够加速衰老,降低GhDAD1的表达量;H2O2对GhDAD1的表达量的影响不大;而NO不同浓度影响不一样,随着浓度的升高,GhDAD1的表达量先升高后降低【。结论】陆地棉中存在抗细胞凋亡基因(GhDAD1)。

关 键 词:棉花  抗细胞凋亡因子  生物信息学  表达模式
收稿时间:2010-03-17;

Chromosome Mapping and Expression Analysis After the Cloning of Defender Against Apoptotic Cell Death Gene from Gossypium hirsutum
GONG Wen-fang,YU Shu-xun,SONG Mei-zhen,FAN Shu-li,PANG Chao-you,XIAO Shui-ping.Chromosome Mapping and Expression Analysis After the Cloning of Defender Against Apoptotic Cell Death Gene from Gossypium hirsutum[J].Scientia Agricultura Sinica,2010,43(18):3713-3723.
Authors:GONG Wen-fang  YU Shu-xun  SONG Mei-zhen  FAN Shu-li  PANG Chao-you  XIAO Shui-ping
Institution:GONG Wen-fang1,2,YU Shu-xun1,SONG Mei-zhen1,FAN Shu-li1,PANG Chao-you1,XIAO Shui-ping1(1 Cotton Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement of Ministry of Agriculture,Anyang 455000,Henan,2College of Plant Science and Technology,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070)
Abstract:Objective Cloning a defender against apoptotic cell death gene,GhDAD1,and analyzing its expression model could provide a theoretical foundation for both molecular mechanism research of apoptosis and breeding senescence-resistant varieties in shorted-season Gossypium hirsutum.Method RT-PCR and in silico cloning were used to amplify DNA sequence and full-length cDNA sequence of GhDAD1 in Gossypium hirsutum.Bioinformatics characterization of GhDAD1 had also been analyzed through all kinds of software.FISH was ...
Keywords:Gossypium hirsutum  defender against apoptotic cell death factor  bioinformatics  expression model  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《中国农业科学》浏览原始摘要信息
点击此处可从《中国农业科学》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号