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亚洲棉(Gossypium arboreum L.)全生育期均一化全长cDNA文库的构建和鉴定
引用本文:王玉荣,张雪妍,刘传亮,陈亚娟,李付广.亚洲棉(Gossypium arboreum L.)全生育期均一化全长cDNA文库的构建和鉴定[J].中国农业科学,2009,42(4):1158-1164.
作者姓名:王玉荣  张雪妍  刘传亮  陈亚娟  李付广
作者单位:1. 中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000;天津科技大学食品工程与生物技术学院,天津,300457
2. 中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点实验室,河南,安阳,455000
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),引进国际先进农业科学技术计划(948计划) 
摘    要: 【目的】构建二倍体亚洲棉石系亚1号全生育期均一化全长cDNA文库,建立亚洲棉功能基因组学研究基础平台,发掘亚洲棉发育、抗逆等相关基因。【方法】取石系亚1号子叶期、苗期、蕾期、花铃期不同组织器官,提取总RNA并分离纯化mRNA,采用SMART技术反转录全长双链cDNA。用DSN(duplex-specific nuclease)法对全长双链cDNA进行均一化,均一化的cDNA连接到λZAPⅡ载体,包装蛋白包装后构建石系亚1号全生育期均一化全长cDNA文库。【结果】初级文库滴度4×106 pfu?ml-1,库容2×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1.5 kb。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequence tags)测序,冗余度仅为3.49%。BLASTN比对结果显示:78.31%的EST为新EST。【结论】文库均一化效果良好,质量符合要求,可能包含大量新基因,是进行EST测序、发掘新基因等棉花功能基因组学的研究平台。

关 键 词:亚洲棉  全生育期  均一化  cDNA文库  EST
收稿时间:2008-4-30

Construction and Characterization of Normalized Full-Length cDNA Library of Asian Cotton(Gossypium arboreum L.)in the Whole-Life Cycle
WANG Yu-rong,ZHANG Xue-yan,LIU Chuan-liang,CHEN Ya-juan,LI Fu-guang.Construction and Characterization of Normalized Full-Length cDNA Library of Asian Cotton(Gossypium arboreum L.)in the Whole-Life Cycle[J].Scientia Agricultura Sinica,2009,42(4):1158-1164.
Authors:WANG Yu-rong  ZHANG Xue-yan  LIU Chuan-liang  CHEN Ya-juan  LI Fu-guang
Institution:Cotton Research Institute, Chinese Academy of Agriculture Sciences/Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture, Anyang
Abstract:
Keywords:EST
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