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家蚕JAK/STAT信号通路相关基因克隆与分析
引用本文:彭景琨,曹广力,钱莹,张晓丽,马焕艳,何蕾,薛仁宇,贡成良.家蚕JAK/STAT信号通路相关基因克隆与分析[J].中国农业科学,2012,45(17):3592-3601.
作者姓名:彭景琨  曹广力  钱莹  张晓丽  马焕艳  何蕾  薛仁宇  贡成良
作者单位:1.苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州 215123
基金项目:高等学校博士学科点专项科研基金项目(优先发展领域)(20113201130002);国家重点基础研究发展计划“973计划”(2012CB114600);江苏省自然科学基金项目(BK2009117);江苏高校优势学科建设工程项目
摘    要:【目的】鉴定家蚕JAK/STAT信号通路组成原件,并预测家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因的功能。【方法】在电子克隆的基础上,通过RT-PCR获得家蚕JAK/STAT信号通路的主要相关基因;利用在线软件对相关蛋白进行结构域分析;基于microarray数据库或qPCR分析各基因的组织表达特征。【结果】克隆了家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因,包括BmSTAT、BmHOP、BmSOCS2、BmSOCS5A、BmSOCS5B、BmSOCS6、BmDRK、Bmken、BmPIAS1、BmPIAS2以及BmPI3K,但没有能克隆到果蝇Upd1、Upd2和Upd3的同源体基因。序列分析显示BmHOP具CRD_FZ、Kringle、转膜区域和PKc超家族蛋白激酶催化结构域TyrKc;BmSTAT有2种亚型,均具SH2、STAT_bind、STAT_int和STAT_alpha结构域;在克隆的BmSOCS家族的3个基因中,BmSOCS2A和BmSOCS6A具典型的SH2和SOCS结构域;BmDRK由SH3和SH2两种结构域形成了SH3-SH2-SH3串联结构;BmKen存在BTB和锌指结构域,BmPIAS1和BmPIAS2具有LCR结构域,BmPI3K具有2个SH2结构域。【结论】成功克隆了家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因。相关蛋白的保守结构域分析显示,在家蚕JAK/STAT信号通路中,BmHOP是JAK激酶的一种,可以磷酸化BmSTAT转录因子,激活靶基因转录;BmSOCS、Bmken、BmPIAS1以及BmPIAS2对JAK/STAT通路起负反馈作用。

关 键 词:家蚕  JAK/STAT通路  基因克隆  序列分析
收稿时间:2011-09-23

Cloning and Sequence Analysis of JAK/STAT Pathway Related Major Genes of Silkworm (Bombyx mori)
PENG Jing-kun,CAO Guang-li,QIAN Ying,ZHANG Xiao-li,MA Huan-yan,HE Lei,XUE Ren-yu,GONG Cheng-liang.Cloning and Sequence Analysis of JAK/STAT Pathway Related Major Genes of Silkworm (Bombyx mori)[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(17):3592-3601.
Authors:PENG Jing-kun  CAO Guang-li  QIAN Ying  ZHANG Xiao-li  MA Huan-yan  HE Lei  XUE Ren-yu  GONG Cheng-liang
Institution:(School of Biology & Basic Medical Sciences,Soochow University,Suzhou 215123,Jiangsu)
Abstract:
Keywords:Bombyx mori  JAK/STAT signaling pathway  gene cloning  sequence analysis
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