| 我国甘薯E病毒全基因组序列特征及荧光定量检测技术的建立 |
| |
| 引用本文： | 唐伟,张成玲,杨冬静,马居奎,陈晶伟,高方园,谢逸萍,孙厚俊.我国甘薯E病毒全基因组序列特征及荧光定量检测技术的建立[J].中国农业科学,2023(20):4010-4020. |
| |
| 作者姓名： | 唐伟 张成玲 杨冬静 马居奎 陈晶伟 高方园 谢逸萍 孙厚俊 |
| |
| 作者单位： | 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所/甘薯育种农业农村部重点实验室 |
| |
| 基金项目： | 国家甘薯产业技术体系（CARS-10）； |
| |
| 摘 要： | 【目的】甘薯E病毒(sweet potato virus E,SPVE)是甘薯上新发现的一种病毒。本研究对我国甘薯E病毒江苏徐州分离物(SPVE-XZ)的全基因组序列进行测定，分析该病毒基因组序列特征，并建立针对SPVE的荧光定量(quantitative PCR,qPCR)检测技术，为监测SPVE发生分布、检测种薯种苗中SPVE带毒情况并及时防控该病毒提供理论依据和技术支持。【方法】采用small RNA深度测序，结合RT-PCR和RACE技术，获得SPVE-XZ的全基因组序列，利用MegAlign、MEGA11等软件对获得的全基因组序列进行序列比对、系统发育关系分析。设计SPVE荧光定量检测引物，并通过对退火温度及引物浓度的优化，建立针对SPVE的qPCR检测方法，测定其特异性和灵敏度，应用于江苏省和山东省田间甘薯样品的检测。【结果】除ploy(A)外，所获得的SPVE-XZ全基因组序列全长为10 919 nt，包含1个长为10 560 nt的开放阅读框(open reading frame,ORF)，编码3 519 aa的多聚蛋白。5′非翻译区(5′untranslated re...
|
| 关 键 词： | 甘薯 甘薯E病毒 全基因组 系统进化分析 qPCR检测 |
|
|
