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水稻胚乳RNA定量RT-PCR分析中参照基因选择
引用本文:李钱峰,蒋美艳,于恒秀,辛世文,顾铭洪,刘巧泉.水稻胚乳RNA定量RT-PCR分析中参照基因选择[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2008,29(2).
作者姓名:李钱峰  蒋美艳  于恒秀  辛世文  顾铭洪  刘巧泉
作者单位:1. 扬州大学,教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室,江苏,扬州,225009;植物分子生物学与生物技术研究所,香港,沙田
2. 扬州大学,教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室,江苏,扬州,225009
3. 香港中文大学,植物分子生物学与生物技术研究所,香港,沙田
基金项目:国家自然科学基金项目 , 江苏省自然科学基金项目(BK2007510):江苏省高校自然科学重大基础研究项目
摘    要:以6个籼粳稻品种胚乳总RNA为研究材料,检测包括eEF-la、eIF-4a、UBC、GAPDH、UBQ-5、TBL和ACTl在内的7个常用管家基因的表达稳定性情况,通过geNorm软件分析选择最佳参照基因.结果表明:不同的品种间,eEF-la和ACT1的表达最为稳定,UBC的表达变化最为明显.当利用多基因作为内参基因时,使用两个最稳定表达的管家基因即可达到准确校正的目的.该结果为水稻等植物中基因表达分析时内参基因的选择提供了参考.

关 键 词:水稻  实时定量RT-PCR  参照基因  基因表达  胚乳

Selection of internal reference genes for quantitative RT-PCR analysis of total RNA from endosperm of rice(Oryza sativa L.)
LI Qian-feng,JIANG Mei-yan,YU Heng-xiu,Xin Shi-wen,GU Ming-hong,LIU Qiao-quan.Selection of internal reference genes for quantitative RT-PCR analysis of total RNA from endosperm of rice(Oryza sativa L.)[J].Journal of Yangzhou University:Agricultural and Life Science Edition,2008,29(2).
Authors:LI Qian-feng  JIANG Mei-yan  YU Heng-xiu  Xin Shi-wen  GU Ming-hong  LIU Qiao-quan
Institution:1.Key Lab of Plant Fun Gen oF MOE;Crop Gen and Phys of Jiangsu Prov;Yangzhou Univ;Yangzhou 225009;China;2.Inst of Plant Mol Bio and Agri-Biotech;The Chinese Univ of Hong Kong;Shatin;Hong Kong
Abstract:Real-time PCR is widely used in gene expression analysis.To get an accurate and reliable result,one or more housekeeping genes are often used as internal control for normalization.However,more and more studies showed that the expression of those commonly used housekeeping genes can't display a stable expression at some experimental conditions.So it is important to choose suitable housekeeping genes for normalization according to actual experimental materials and conditions.In this study,seven frequently use...
Keywords:rice  real-time quantitative PCR  reference gene  gene expression  endosperm  
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