| 基于SLAF-BSA技术的蝴蝶兰花底色关联SNP分子标记开发与验证 |
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| 引用本文： | 肖文芳,李佐,陈和明,吕复兵.基于SLAF-BSA技术的蝴蝶兰花底色关联SNP分子标记开发与验证[J].中国农业大学学报,2021,26(9):92-100. |
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| 作者姓名： | 肖文芳 李佐 陈和明 吕复兵 |
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| 作者单位： | 广东省农业科学院 环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室, 广州 510640 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划项目(2018B020202001)；2020年省级农业科技创新及推广项目(2020KJ121)；广东省农业科学院学科团队建设项目(202127TD) |
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| 摘 要： | 为筛选与蝴蝶兰花黄白底色相关的单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)位点,以'黄金豹'蝴蝶兰(♀)和'白天使'蝴蝶兰(♂)及其杂交后代为实验材料,选择33个分布在5个不同颜色分布类型组群中的黄色底色杂交后代和仅有的2个纯黄色个体作为黄色底色群体,35个分布在对应5个颜色分布类型组群中的白色底色杂交后代作为白色底色群体,分别提取DNA并等量混合后构建2个不同底色DNA混池,采用特异位点扩增片段测序(SLAF-seq)结合BSA技术,对与花底色密切相关的候选标记进行鉴定。结果表明:共获得164 874个SLAF标签,其中含21 031个多态性SLAF标签,多态率为12.76%。SLAF标记在亲本中的平均序列深度为42×,在子代中的平均序列深度为46×。关联分析表明,在阈值0.745 5时,筛选得到15个与花底色相关的SLAF候选标记,具27个SNP位点。采用SNaPshot测序技术在2个亲本、11个子代和4个不同的种质资源中验证SNP位点,筛选发现,Marker35886和Marker70907的2个SNP位点与相关SLAF序列中的SNP位点一致,对花底色的鉴定准确率分别为66.67%和73.33%,组合准确率达93.33%。本研究筛选到的2个SNP位点可作为有效的分子标记位点在蝴蝶兰育种早期进行辅助选择。
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| 关 键 词： | 蝴蝶兰 底色 SLAF-BSA SNP |
| 收稿时间： | 2020/11/25 0:00:00 |
Identification and validation of single-nucleotide polymorphism markers linked to flower ground color in Phalaenopsis by using combined specific-locus amplified fragment sequencing and bulked segregant analysis |
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| XIAO Wenfang,LI Zuo,CHEN Heming,LV Fubing.Identification and validation of single-nucleotide polymorphism markers linked to flower ground color in Phalaenopsis by using combined specific-locus amplified fragment sequencing and bulked segregant analysis[J].Journal of China Agricultural University,2021,26(9):92-100. |
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| Authors: | XIAO Wenfang LI Zuo CHEN Heming LV Fubing |
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| Institution: | Environmental Horticulture Research Institute/Guangdong Key Lab of Ornamental Plant Germplasm Innovation and Utilization, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Phalaenopsis flower ground color SLAF-BSA SNP |
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