| 加权基因共表达网络分析在畜禽研究中的应用 |
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| 引用本文： | 龚高,严晓春,王凤红,张磊,李文泽,闫晓敏,刘虹夫,吕琦,李金泉,苏蕊.加权基因共表达网络分析在畜禽研究中的应用[J].中国农业大学学报,2022,27(7):159-171. |
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| 作者姓名： | 龚高 严晓春 王凤红 张磊 李文泽 闫晓敏 刘虹夫 吕琦 李金泉 苏蕊 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学 动物科学学院/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室/内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心, 呼和浩特 010018;内蒙古农业大学 动物科学学院/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室/内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心, 呼和浩特 010018; 内蒙古金莱牧业科技有限责任公司, 呼和浩特 010018 |
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| 基金项目： | 内蒙古自治区科技重大专项(2021ZD0012)；西部青年学者项目；中央引导地方科技发展资金项目(2020ZY0007)；财政部和农业农村部:国家绒毛用羊产业技术体系(CARS-39)；国家自然科学基金项目(31860639) |
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| 摘 要： | 为了解加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis，WGCNA)方法在畜禽中的应用研究，本文对近年来国内外通过WGCNA方法对牛、羊、猪、禽等畜禽进行研究的相关文献进行了整理与分析，总结了WGCNA方法应用的一般分析流程、策略及畜禽WGCNA的研究现状。结果表明:WGCNA是一种系统生物学的方法，可分析转录组、蛋白组、代谢组、DNA甲基化和单细胞转录组等高通量数据，解析分子间调控的表达模式，确定关键调控因子；在畜禽的研究中，WGCNA方法已经广泛应用在生长性状、繁殖性状、抗病性状和品质性状等复杂性状的优势功能因子的挖掘。综上，WGCNA方法对分析组学数据具有较强的优势，可为畜禽重要经济性状的挖掘，阐明性状生物学机制提供助力。
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| 关 键 词： | WGCNA 网络分析 高通量测序 畜禽 |
| 收稿时间： | 2021/5/25 0:00:00 |
Application of weighted gene co-expression network analysis in domestic animal research |
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| GONG Gao,YAN Xiaochun,WANG Fenghong,ZHANG Lei,LI Wenze,YAN Xiaomin,LIU Hongfu,LV Qi,LI Jinquan,SU Rui.Application of weighted gene co-expression network analysis in domestic animal research[J].Journal of China Agricultural University,2022,27(7):159-171. |
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| Authors: | GONG Gao YAN Xiaochun WANG Fenghong ZHANG Lei LI Wenze YAN Xiaomin LIU Hongfu LV Qi LI Jinquan SU Rui |
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| Institution: | College of Animal Science/Key Laboratory of Mutton Sheep Genetics and Breeding of Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Engineering Research Center for Goat Genetics and Breeding of Inner Mongolia Autonomous Region, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China;College of Animal Science/Key Laboratory of Mutton Sheep Genetics and Breeding of Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Engineering Research Center for Goat Genetics and Breeding of Inner Mongolia Autonomous Region, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China; Inner Mongolia Jinlai Livestock Technology Co., Ltd., Hohhot 010018, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | WGCNA network analysis high throughput sequencing domestic animals |
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