牦牛卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体的转录组分析 |
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引用本文: | 何向东,字向东,夏忆,陈莹.牦牛卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体的转录组分析[J].中国农业大学学报,2022,27(5):216-226. |
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作者姓名: | 何向东 字向东 夏忆 陈莹 |
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作者单位: | 西南民族大学 动物科学国家民委重点实验室, 成都 610041 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2018YFD0502303);中央高校基本科研业务费专项资金项目(2020PTJS21001) |
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摘 要: | 为探讨牦牛有腔卵泡发育过程中卵丘卵母细胞复合体(Cumulus-oocyte complexes,COCs)mRNA转录组变化,对牦牛小(2~3 mm)、中(4~5 mm)、大有腔卵泡(6~8 mm)中的COCs进行Illumina平台测序,筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并进行GO分析和KEGG分析。结果表明,1)牦牛小、中、大3个阶段的卵泡COCs中共有17 342个基因表达;2)小卵泡与中卵泡COCs之间有879个DEGs,其中,上调435个,下调444个;DEGs注释到106条GO条目,其中生物过程(BP)类别46条,细胞组成(CC)类别25条,分子功能(MF)类别35条,涉及254条KEGG通路。中卵泡与大卵泡COCs之间有1 560个DEGs,其中,上调590个,下调970个;3)DEGs注释到114条GO条目,其中BP 55条、CC 26条和MF 33条,涉及276条KEGG通路,DEGs主要富集在神经活性配体-受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞粘附分子、钙离子信号通路和cAMP信号通路等重要通路。综上,牦牛卵泡在不同发育阶段的DEGs、GO条目和KEGG pathway存在明显差异,为揭示牦牛卵泡发育分子调控机制,改善牦牛卵母细胞体外成熟技术提供了理论依据。
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关 键 词: | 牦牛 卵丘卵母细胞复合体 转录组 转录组测序 |
收稿时间: | 2021/3/10 0:00:00 |
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