香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析 |
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引用本文: | 董晨,胡会刚,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良.香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析[J].湖北农业科学,2016(12):3200-3204. |
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作者姓名: | 董晨 胡会刚 贾利强 决登伟 赵秋芳 陈宏良 |
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作者单位: | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树分子生物学重点实验室,广东湛江,524091 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062014010),海南省自然科学基金项目(20153134) |
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摘 要: | 为了研究香蕉(Musa nana Lour.)α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶(α-1,4-glucan starch phosphorylase,PHS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对香蕉PHS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。结果表明,在香蕉中共鉴定出2个成员,Ma PHS1的开放阅读框长度为2 784 bp,编码927个氨基酸,分子质量为104.8 ku,等电点为6.59;Ma PHS2的开放阅读框长度为2 517 bp,编码838个氨基酸,分子质量为95.09 ku,等电点为6.09。Ma PHS1和Ma PHS2分别含有17个和15个外显子;Ma PHS1和Ma PHS2均含有淀粉磷酸化酶的保守性基序,进化过程中比较保守。
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关 键 词: | 香蕉(Musa nana Lour.) α-1 4-葡聚糖淀粉磷酸化酶 生物信息 基因家族 进化分析 |
Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of a-1,4-glucan Starch Phosphorylase Gene Family of Banana |
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Abstract: | |
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Keywords: | banana (Musa nana Lour ) α-1 4-glucan starch phosphorylase bioinformatics gene family phylogeny analyses |
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