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香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析
引用本文:董晨,胡会刚,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良.香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析[J].湖北农业科学,2016(12):3200-3204.
作者姓名:董晨  胡会刚  贾利强  决登伟  赵秋芳  陈宏良
作者单位:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树分子生物学重点实验室,广东湛江,524091
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062014010),海南省自然科学基金项目(20153134)
摘    要:为了研究香蕉(Musa nana Lour.)α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶(α-1,4-glucan starch phosphorylase,PHS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对香蕉PHS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。结果表明,在香蕉中共鉴定出2个成员,Ma PHS1的开放阅读框长度为2 784 bp,编码927个氨基酸,分子质量为104.8 ku,等电点为6.59;Ma PHS2的开放阅读框长度为2 517 bp,编码838个氨基酸,分子质量为95.09 ku,等电点为6.09。Ma PHS1和Ma PHS2分别含有17个和15个外显子;Ma PHS1和Ma PHS2均含有淀粉磷酸化酶的保守性基序,进化过程中比较保守。

关 键 词:香蕉(Musa  nana  Lour.)  α-1  4-葡聚糖淀粉磷酸化酶  生物信息  基因家族  进化分析

Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of a-1,4-glucan Starch Phosphorylase Gene Family of Banana
Abstract:
Keywords:banana (Musa nana Lour  )  α-1  4-glucan starch phosphorylase  bioinformatics  gene family  phylogeny analyses
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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