| 拟南芥POT基因密码子使用特性分析 |
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| 引用本文： | 汪福源,唐宁,杨平.拟南芥POT基因密码子使用特性分析[J].湖北农业科学,2013,52(4). |
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| 作者姓名： | 汪福源 唐宁 杨平 |
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| 作者单位： | 1. 中国药科大学高等职业技术学院,南京,211198
2. 南京晓庄学院生物化工与环境工程学院,南京,211171 |
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| 基金项目： | 南京晓庄学院博士启动基金项目，南京晓庄学院青年专项 |
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| 摘 要： | 运用CodonW程序对拟南芥(Arabidopsis thaliana)POT基因密码子组成、同义密码子使用频率和全长编码区密码子进行分析.结果表明,拟南芥POT基因密码子适应指数(CAI)与同义密码子第三位碱基含量(C3s)、密码子偏爱指数(CBI)均呈显著正相关(P＜0.05),与最优密码子使用频率(FOP)呈极显著正相关(P＜0.01).有效密码子数(ENC)与同义密码子第三位碱基含量(C3s)呈显著正相关(P＜0.05),与GC3s呈极显著正相关(P＜0.01),与同义密码子第三位碱基含量(T3s)呈极显著负相关(P＜0.01).拟南芥POT基因密码子使用相对概率(RSCU)＞1的密码子多以碱基A或T结尾.
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| 关 键 词： | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) POT基因 密码子 |
Characterization of Codon Usage of Arabidopsis thaliana POT Gene |
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| WANG Fu-yuan
,
TANG Ning
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YANG Ping.Characterization of Codon Usage of Arabidopsis thaliana POT Gene[J].Hubei Agricultural Sciences,2013,52(4). |
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| Authors: | WANG Fu-yuan TANG Ning YANG Ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Arabidopsis thaliana POT gene codon |
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