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弓形虫MIC3蛋白质的二级结构及B细胞抗原表位预测
引用本文:江涛,马立安,赵俊龙.弓形虫MIC3蛋白质的二级结构及B细胞抗原表位预测[J].长江大学学报,2007,4(1):1-4.
作者姓名:江涛  马立安  赵俊龙
作者单位:[1]长江大学动物科学学院,湖北荆州434025 [2]华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,湖北武汉430070 [3]长江大学生命科学学院,湖北荆州434025 [4]华中农业大学动物医学院华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,湖北武汉430070
基金项目:教育部高等学校博士点科研基金项目(编号:20040504016);教育部重点科研项目(编号:105120)
摘    要:目的:预测弓形虫MIC3的二级结构和B细胞抗原表位。方法:采用PCR技术从弓形虫RH株的基因组DNA中扩增编码MIC3的全长基因,经酶切及DNA测序鉴定,推导出相应的氨基酸序列,并与GenBank上已知氨基酸序列(登录号CAB56644)进行比对。然后采用Garnier-Robson方法、Chou-Fas-man方法和Karplus-Schulz方法预测蛋白质的二级结构;按Hopp-Woods方案、Emini方案及Jameson-Wolf方案分别预测蛋白质的亲水性、表面可能性以及抗原性指数,并综合分析预测MIC3的B细胞抗原表位。结果:根据扩增基因推导MIC3的氨基酸序列与GenBank上相应氨基酸序列的同源性达99·7%,预测其结构中含有较多的α-螺旋、少量的β-折叠、非常丰富的β-转角和一定的不规则卷曲区段,在MIC3的N端第83~94、第136~141区段和第240~243区段内或其附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。结论:预测MIC3的二级结构和B细胞表位,为人工合成优势肽段进行弓形虫病的疫苗研究提供依据。

关 键 词:刚地弓形虫  MIC3  基因克隆  二级结构  B细胞抗原表位
文章编号:1673-1409(2007)01-R001-04
修稿时间:2007-01-26

Prediction of the Secondary Structure and B Cell Epitope for the Toxoplasma Gondii MIC3
JIANG Tao.Prediction of the Secondary Structure and B Cell Epitope for the Toxoplasma Gondii MIC3[J].Journal of Yangtze University,2007,4(1):1-4.
Authors:JIANG Tao
Abstract:
Keywords:Toxoplasma gondii  MIC3  Gene clone  Secondary Structure  B Cell Epitope
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