| 基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发 |
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| 引用本文： | 吴根松,孙丽丹,张启翔,潘会堂,蔡明.基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发[J].北京林业大学学报,2011,33(5):103-108. |
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| 作者姓名： | 吴根松 孙丽丹 张启翔 潘会堂 蔡明 |
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| 作者单位： | 北京林业大学园林学院, 国家花卉工程技术研究中心 |
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| 基金项目： | 林业公益性行业科研专项(201004012); 北京市教育委员会共建项目建设计划“梅花远缘杂交新品种选育及核心种质的保存繁殖与示范”; 国家生物育种专项高技术产业化项目计划“云南‘丽江照水’梅良种高技术产业化示范工程” |
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| 摘 要： | 为获得更多的梅花SSR引物,本研究筛选了84对梅花近缘物种的引物,并从梅花EST数据库的序列中设计了23对EST-SSR引物,用12个梅花品种对这些引物进行了多态性检测。结果表明,近缘物种的引物有69对能扩增出条带,有效扩增率达82.1%,从中筛选的14对引物共得到85个等位基因,平均值为6个。有效等位基因数在2.07...
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| 关 键 词： | 近缘物种 EST 梅花 SSR |
| 收稿时间： | 1900-01-01 |
Development of mei flower's SSR primers from closely related species' SSR and EST-SSR |
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| WU Gen-song, SUN Li-dan, ZHANG Qi-xiang, PAN Hui-tang, CAI Ming.Development of mei flower's SSR primers from closely related species' SSR and EST-SSR[J].Journal of Beijing Forestry University,2011,33(5):103-108. |
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| Authors: | WU Gen-song SUN Li-dan ZHANG Qi-xiang PAN Hui-tang CAI Ming |
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| Institution: | National Engineering Research Center for Floriculture, College of Landscape Architecture, Beijing Forestry University, 100083, P. R. China. |
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| Abstract: | In this study,we analyzed 84 SSR primer pairs from closely related species and designed 23 EST-SSR primer pairs from NCBI for developing more mei flower(Prunus mume Sieb.et Zucc.)new SSR makers.Twelve mei flower cultivars were used to do polymorphic test on these primers.The results show that 69 SSR primer pairs can amplify bands with the efficient amplification ratio of 82.1%.A total of 85 alleles were detected by 14 primer pairs with an average of six effective alleles per primer.The effective number of a... |
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| Keywords: | closely related species EST mei flower SSR |
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