| 杨树HSF家族基因生物信息学与胁迫应答表达分析 |
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| 引用本文： | 王雪怡,顾咏梅,张雪梅,姜廷波,刘焕臻.杨树HSF家族基因生物信息学与胁迫应答表达分析[J].北京林业大学学报,2021,43(2):34-45. |
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| 作者姓名： | 王雪怡 顾咏梅 张雪梅 姜廷波 刘焕臻 |
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| 作者单位： | 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室，黑龙江 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | 转基因生物新品种培育重大专项 |
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| 摘 要： | 目的 探究小黑杨热激转录因子HSF在应答高温和高盐胁迫时发挥的关键作用。保守结构域和顺式作用元件预测等对杨树HSF转录因子家族基因进行生物信息学分析。本研究以小黑杨为材料，经过37 ℃高温胁迫半个月后观察其形态变化；将小黑杨在37 ℃下分别处理0、12、24、48 h，采用RT-qPCR对小黑杨组织中的PsnHSFs基因进行时空表达分析；将小黑杨于150 mmol/L NaCl胁迫分别处理0、24 h，通过RNA-seq分析PsnHSFs基因的相对表达量变化，并通过RT-qPCR进行验证。 结果 通过结构特征和系统发育比较将29个HSF转录因子家族基因分成A、B和C三个亚家族，各亚家族分别包含18、10和1个HSF基因；HSF编码的氨基酸序列长度介于209 ~ 595之间，均为亲水性蛋白；其N端具有高度保守的DBD结构域，由三个保守基序构成；HSF基因启动子序列中包含DRE core、ABRE和TC-rich等多种顺式作用元件。小黑杨经37 ℃高温处理后其株高仅为对照的76.51%，叶片呈卷曲状，叶表面粗糙，叶面积显著减小且苗干多侧枝柔软无韧性。RT-qPCR与RNA-seq结果表明，PsnHSFs被高温、高盐胁迫诱导表达。高温处理后其株高仅为对照的76.51%，叶片呈卷曲状，叶表面粗糙，叶面积显著减小且苗干多侧枝柔软无韧性。RT-qPCR与RNA-seq结果表明，PsnHSFs被高温、高盐胁迫诱导表达。家族基因以及揭示HSF参与木本植物胁迫应答的分子机制调控具有参考意义。
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| 关 键 词： | 小黑杨 PsnHSFs 生物信息学 胁迫应答 |
| 收稿时间： | 2020-05-25 |
Bioinformatics and stress response expression analysis of poplar HSF family genes |
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| Wang Xueyi,Gu Yongmei,Zhang Xuemei,Jiang Tingbo,Liu Huanzhen.Bioinformatics and stress response expression analysis of poplar HSF family genes[J].Journal of Beijing Forestry University,2021,43(2):34-45. |
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| Authors: | Wang Xueyi Gu Yongmei Zhang Xuemei Jiang Tingbo Liu Huanzhen |
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| Institution: | State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Northeast Forestry University, Harbin 150040, Heilongjiang, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Populus simonii×P nigra PsnHSFs bioinformatics stress response |
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