| 高粱基因组DCL家族的系统进化与表达分析 |
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| 引用本文： | 张腾,尹梦娇,郭红媛,姜晓东,贾举庆,王艳胜,温贺,梁月秀,赵立松,赵威军,吕晋慧,李艳锋,张春来.高粱基因组DCL家族的系统进化与表达分析[J].山西农业科学,2019(6):950-956. |
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| 作者姓名： | 张腾 尹梦娇 郭红媛 姜晓东 贾举庆 王艳胜 温贺 梁月秀 赵立松 赵威军 吕晋慧 李艳锋 张春来 |
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| 作者单位： | 山西农业大学农学院国家功能杂粮技术创新中心山西省旱作栽培与作物生态重点实验室山西省黄土高原特色作物高效生产协同创新中心;山西省农业科学院高粱研究所;山西农业大学林学院 |
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| 摘 要： | 从高粱转录组数据筛选获得SbDCLs基因全长序列,并结合生物信息学方法在高粱的全基因组中鉴定出了6个SbDCLs基因,分布于SBI-01,SBI-03和SBI-06上。其中,SbDCL2a和SbDCL2b在SBI-01上串联重复排列,比较二者基因结构和蛋白质结构域推测SbDCL2a很可能是由SbDCL2b小范围复制所致。SbDCLs蛋白质均为两性蛋白且没有信号肽,亚细胞定位均在细胞核上,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。通过对高粱、水稻、玉米、拟南芥、大豆、小麦、藜麦、甜菜、谷子的DCL蛋白质序列进行系统进化分析,结果表明,DCL存在4个分枝:DCL1,DCL2,DCL3和DCL4;DCL在进化上出现了单双子叶的分化;DCL蛋白编码基因进化具有纯化效应。对SbDCLs基因进行表达分析,结果显示,SbDCLs在高粱穗部、茎节中部、花梗和旗叶茎节表达都比较强烈;SbDCL2a,SbDCL1和Sb DCL3a是高度表达基因,而且在生殖器官或组织中相对于营养器官具有更高的表达水平,说明SbDCLs基因对高粱营养生长和生殖发育具有调控作用。SbDCL2b在高粱的整个生育期表达水平均较低,但是在胚珠和花粉中拥有较高的表达水平,可能参与生殖发育调控。
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| 关 键 词： | 高粱 DCL基因 系统进化分析 表达分析 |
Phylogenetic Analysis and Expression Analysis of DCL Gene Family in the Genome of Sorghum bicolor |
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