| 膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析 |
| |
| 引用本文： | 邓楠,史胜青,常二梅,刘建锋,兰倩,江泽平.膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析[J].东北林业大学学报,2015(2):28-32. |
| |
| 作者姓名： | 邓楠 史胜青 常二梅 刘建锋 兰倩 江泽平 |
| |
| 作者单位： | 中国林业科学研究院林业研究所，北京，100091 |
| |
| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金( RIF2010-10)；林木遗传育种国家重点实验室专项课题( TGB2013012)。 |
| |
| 摘 要： | 以不同萌发期间的膜果麻黄(E.przewalskii)种子为研究对象,应用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi SeqTM2000对其进行转录组测序和数据重新组装,结果获得了12 999 122条初始序列,总长为1 169 920 980bp,初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp;与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了49 449个GO功能注释、17 751个COG功能注释以及16 748个KEGG注释;并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。
|
| 关 键 词： | 膜果麻黄 转录组 芪类 高通量测序 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
