| 菊花EST-SSR分析及标记开发 |
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| 引用本文： | 万志兵,陈燕,闫莹莹,陈黎.菊花EST-SSR分析及标记开发[J].西南林业大学学报,2013(1):39-44. |
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| 作者姓名： | 万志兵 陈燕 闫莹莹 陈黎 |
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| 作者单位： | 黄山学院生命与环境科学学院 |
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| 基金项目： | 安徽省教育厅自然科学项目(KJ2011B169)资助;高校省级优秀青年人才基金项目(2012SQRL185)资助 |
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| 摘 要： | 为了开发菊花的分子标记,对7 087条菊花EST进行拼接,得到275个contigs,发现50个SSR位点;在拼接的contigs中SSR平均密度为每2 854.3 bp含有1个SSR。三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占总数的50.00%;在二碱基重复中,最主要的优势重复基元是AC和AG;三碱基中CAT和CCA为优势重复基元;四碱基、五碱基重复类型中,(TTTN)n和(ATTTN)n重复基元为对应优势基元;这些优势重复基元中富含碱基A和T,菊花EST序列中高度变异的微卫星(长度>20 bp)约占2.00%。根据得到的菊花EST-SSR,共设计出428对引物,并选取了28对SSR引物对黄山贡菊基因组DNA进行PCR扩增,其中有27对引物扩增成功。
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| 关 键 词： | 表达序列标签 简单重复序列 微卫星变异 菊花 |
EST-SSR Analysis and Marker Development for Chrysanthemum morifolium |
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| WAN Zhi-bing,CHEN Yan,YAN Ying-ying,CHEN Li.EST-SSR Analysis and Marker Development for Chrysanthemum morifolium[J].Journal of Southwest Forestry University,2013(1):39-44. |
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| Authors: | WAN Zhi-bing CHEN Yan YAN Ying-ying CHEN Li |
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| Institution: | (College of Life and Environmental Sciences,Huangshan University,Huangshan Anhui 245041,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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