| 牛PEG11基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 石运娇,苏红,张坤,李冬杰,李世杰.牛PEG11基因生物信息学分析[J].河北农业大学学报,2013(1):95-99. |
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| 作者姓名： | 石运娇 苏红 张坤 李冬杰 李世杰 |
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| 作者单位： | 河北农业大学生命科学学院;中国地质大学长城学院;河北科技大学生物科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30972098);河北省自然基金项目(C2011204001);国家重大科技专项(2008ZX0806-004) |
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| 摘 要： | 采用生物信息学方法对牛PEG11基因进行分析,为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机理奠定基础。选取6种哺乳动物PEG11基因的CDS序列作为研究对象,进化分析表明:包括牛、羊、小鼠、熊猫、猪和人在内的6种哺乳动物间的遗传距离小于0.109,且牛与猪遗传距离最小,为0.036,与基因进化树分析结果一致。CpG岛在线软件预测显示,在牛中该基因上游5kb内没有CpG岛。启动子在线软件预测和转录因子分析相结合显示,启动子可能位于该基因5′端上游2 181～2 131bp处,此区域包括大量潜在转录因子结合位点,并在2 173bp处存在一个TATA框。蛋白质在线软件分析表明,PEG11基因编码一种螺旋形跨膜蛋白质,有α-螺旋、β-转角和自由卷曲3种二级结构。
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| 关 键 词： | 牛 PEG11基因 生物信息学 |
Bioinformatics analysis of bovine PEG11gene |
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| SHI Yun-jiao,SU Hong,ZHANG Kun,LI Dong-Jie,LI Shi-jie.Bioinformatics analysis of bovine PEG11gene[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2013(1):95-99. |
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| Authors: | SHI Yun-jiao SU Hong ZHANG Kun LI Dong-Jie LI Shi-jie |
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| Institution: | 1(1.College of Life Science,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,China;2.China University of Geosciences Great Wall College,Baoding 071001;3.College of Life Science and Technology,Hebei University of Science and Technology,Shijiazhuang 050018,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bovine PEG11gene bioinformatic analysis |
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