| 黄瓜绿斑驳病毒河北分离物外壳蛋白基因序列分析及其分组 |
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| 引用本文： | 钟敏,赵绪生,何乙坤,胡同乐,王树桐,王亚南,曹克强.黄瓜绿斑驳病毒河北分离物外壳蛋白基因序列分析及其分组[J].河北农业大学学报,2015(1). |
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| 作者姓名： | 钟敏 赵绪生 何乙坤 胡同乐 王树桐 王亚南 曹克强 |
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| 作者单位： | 河北农业大学植物保护学院,河北 保定,071001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31201487)；河北省自然科学基金资助项目(C2013204058)；“河北省青年拔尖人才计划”资助． |
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| 摘 要： | 为了揭示黄瓜绿斑驳病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)河北分离物分子变异及系统进化情况。本研究自河北省5个代表性西瓜产区采集病样,分离纯化获得5个CGMMV河北分离物,经RTPCR扩增、基因克隆获各分离物的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列。使用Vector NTI 10.0软件(Informax,Frederick,MD,USA)和MEGA5.0软件(Koichiro,Tokyo,Japan)对河北省5个分离物及GenBank已登录其它分离物CP进行序列分析,构建系统发育树。系统进化关系分析表明:所有CGMMV分离物可划分为5个组,CGMMV河北分离物与中、日、韩三国分离物亲缘关系较近,位于同一组别。与希腊2个分离物(CGMMV-GR5、GR3)亲缘关系最远。CGMMV CP序列相似性分析结果表明:河北省5个分离物CP核苷酸、氨基酸序列相似性在99%~100%之间,与其它17个分离物序列相似性在92%~100%之间。与中国LN及Liaoning两个分离物及韩国Watermelon分离物相似性最高为100%,与希腊2个分离物(GR5、GR3)序列相似性最低为92%~99%。揭示了CGMMV河北分离物的分类地位及其与不同来源分离物之间的遗传进化关系,为进一步研究CGMMV株系划分、基因遗传变异提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 黄瓜绿斑驳病毒 外壳蛋白 序列分析 系统进化关系 |
Sequence analysis of the coat protein and grouping of cucumber green mottle mosaic virus isolated from Hebei |
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| ZHONG Min,ZHAO Xu-sheng,HE Yi-kun,HU Tong-l e,WANG Shu-tong,WANG Ya-nan,CAO Ke-qiang.Sequence analysis of the coat protein and grouping of cucumber green mottle mosaic virus isolated from Hebei[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2015(1). |
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| Authors: | ZHONG Min ZHAO Xu-sheng HE Yi-kun HU Tong-l e WANG Shu-tong WANG Ya-nan CAO Ke-qiang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cucumber green mottle mosaic virus coat protein gene sequence analysis phylo-genetic relationship |
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