植物UGD基因家族系统发育分析及在棉纤维中的表达分析 |
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引用本文: | 潘玉欣,何易航,张岚,王振怡,肖嵩,王希胤.植物UGD基因家族系统发育分析及在棉纤维中的表达分析[J].河北农业大学学报,2018(3). |
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作者姓名: | 潘玉欣 何易航 张岚 王振怡 肖嵩 王希胤 |
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作者单位: | 华北理工大学生命科学学院;唐山市第一中学 |
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摘 要: | 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸(UDP-glucose dehydrogenase,UGD)是植物细胞壁合成的主要前体物质。本研究利用生物信息学方法分析了15个植物基因组中UGD基因家族的基因结构,系统进化,以及其中7个双子叶植物的种内共线性,染色体定位。利用荧光定量PCR方法分析了UGD家族基因在陆地棉棉纤维不同发育时期的表达。结果表明:15个物种中共鉴定出56个UGD基因,可聚为2个进化群,藻类单独成一个群,其他植物构成一个群,各物种均有UGD家族基因的特异进化枝。藻类植物UGD家族均含有内含子。大片段复制是UGD家族基因扩增的主要动力。12个陆地棉UGD基因在棉纤维不同发育时期均有表达,多数基因在20DPA或25DPA基因表达量较高。
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