secY和nusA基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用 |
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引用本文: | 张 磊,韩 翔,李正男.secY和nusA基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2012,40(11):91-96. |
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作者姓名: | 张 磊 韩 翔 李正男 |
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作者单位: | 西北农林科技大学 林学院;西北农林科技大学 理学院;西北农林科技大学 植物保护学院 |
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基金项目: | 林业公益性行业科研专项(201004003-4);教育部长江学者和创新团队发展计划项目 |
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摘 要: | 【目的】利用分子生物学方法分析泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因,从亚组水平上确定陕西泡桐丛枝植原体的分类地位。【方法】采集陕西杨凌、彬县、旬邑、永寿、周至和宝鸡等6个泡桐栽培区的泡桐丛枝样品,提取病样总核酸;设计引物对secY-F/R和nusA-F/R,对泡桐丛枝植原体secY、nusA基因进行PCR扩增及核苷酸序列测定与系统发育分析。【结果】获得了泡桐丛枝病植原体secY基因序列的全长,大小为1 358bp,编码414个氨基酸;获得了部分nusA基因序列,大小为946bp,编码315个氨基酸。序列同源性分析结果表明,陕西各县区泡桐丛枝植原体的secY、nusA基因序列均一致。一致性分析和系统发育分析表明,陕西泡桐丛枝植原体与台湾泡桐丛枝植原体的亲缘关系最近,secY、nusA基因序列的同源性分别为99.9%和99.6%。【结论】首次报道了泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因的序列,并以其作为分类标准,将陕西泡桐丛枝植原体归属到16SrⅠ-D亚组。
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关 键 词: | 泡桐丛枝植原体 secY基因 nusA基因 序列分析 |
收稿时间: | 2012/3/28 0:00:00 |
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