APEC感染雏鸡小肠炎症相关基因的RNA-Seq分析 |
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引用本文: | 王 琦,祁克宗,涂 健,等.APEC感染雏鸡小肠炎症相关基因的RNA-Seq分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2017,45(8):23-28. |
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作者姓名: | 王 琦 祁克宗 涂 健 等 |
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作者单位: | 安徽农业大学 动物科技学院,安徽农业大学 动物科技学院,安徽农业大学 动物科技学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31372402);国家自然科学基金青年项目(31502038) |
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摘 要: | 【目的】研究禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡小肠炎症相关基因表达的变化。【方法】对14日龄雏鸡腿部肌肉注射0.5mL/羽1×106 CFU/mL的APEC菌液,观察雏鸡的发病情况,并取病变严重雏鸡空肠为测序样品,同时以注射等量生理盐水为对照,采用RNA高通量测序(RNA-Seq)技术,筛选分析感染和未感染APEC雏鸡小肠炎症相关基因表达的变化。【结果】以差异倍数在2倍及以上为标准,从试验组与对照组共筛选出差异表达基因131个。GO分类结果显示,有87个差异基因得到491个GO功能注释,这些基因主要富集在炎症反应、肝素整合、白细胞介素-6的生物合成等过程。基于KEGG分析,仅有29个差异基因得到注释,涉及41个信号通路,主要参与的信号通路有PPAR、花生四烯酸代谢、MAPK等。【结论】APEC感染雏鸡后会引起机体炎症相关基因表达的变化,从中筛选出10个可能在炎症反应中具有重要影响的炎症相关基因。
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关 键 词: | 禽致病性大肠杆菌 雏鸡小肠 RNA高通量测序 炎症相关基因 |
收稿时间: | 2016/7/4 0:00:00 |
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