| 林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵 位,王吴优,程建国,等.林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2017,45(12):23-30. |
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| 作者姓名： | 赵 位 王吴优 程建国 等 |
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| 作者单位： | 四川农业大学 动物医学院,四川农业大学 动物医学院,四川养麝研究所 |
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| 基金项目： | 四川省学术和技术带头人培养资助项目；四川农业大学双支项目 |
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| 摘 要： | 【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析,并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列进行测定;以小鼠感染试验和半数致死量(LD50)测试该病原菌的致病性;用全基因组测序方法对病原菌基因组进行测序分析,并对发现的新基因编码产物进行生物信息学分析。【结果】经生理生化试验和16SrRNA序列分析发现,分离菌株为肺炎克雷伯氏菌,命名为GPKP,其对小鼠致死的LD50为6.3×107CFU/mL。该菌基因组大小为4 879 707bp,包含5 490个开放阅读框,共注释到22组COG功能。kp05372基因编码产物由302个氨基酸组成,无信号肽,是一种不稳定的、在细胞内发挥生理作用的亲水性蛋白。【结论】分离的细菌为肺炎克雷伯氏菌,kp05372基因编码产物属于典型的LysR家族转录因子(LTTR)。
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| 关 键 词： | 林麝 肺炎克雷伯氏菌 kp05372 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2016/10/17 0:00:00 |
Isolation and identification of Klebsiella pneumoniae from forest musk deer and bioinformatics analysis of its kp05372 gene |
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| ZHAO Wei,WANG Wuyou and CHENG Jianguo,et al.Isolation and identification of Klebsiella pneumoniae from forest musk deer and bioinformatics analysis of its kp05372 gene[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2017,45(12):23-30. |
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| Authors: | ZHAO Wei WANG Wuyou and CHENG Jianguo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | forest musk deer Klebsiella pneumoniae kp05372 bioinformatics analysis |
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