| 寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析 |
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| 引用本文： | 张 伟,徐 珂,王秦虎.寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2011,39(12):124-128. |
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| 作者姓名： | 张 伟 徐 珂 王秦虎 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学 生命科学学院;西北农林科技大学 生命科学学院;西北农林科技大学 生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划项目（2008AA02Z110） |
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| 摘 要： | 【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,为探明microRNA对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(Phytophthora parasitica)和模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,构建其靶标调控网络,并进行Gene Ontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的Solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microRNA,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;Gene Ontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microRNA靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。
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| 关 键 词： | MicroRNA 生物胁迫 调控网络 GO分析 |
| 收稿时间： | 2011/5/23 0:00:00 |
Analysis of the regulation network of microRNA targets in Arabidopsis thaliana infected with Phytophthora parasitica |
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| ZHANG Weia,XU Kea,WANG Qin-hua,WANG Xiao-longa,SHAN Wei-xingb,c.Analysis of the regulation network of microRNA targets in Arabidopsis thaliana infected with Phytophthora parasitica[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2011,39(12):124-128. |
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| Authors: | ZHANG Weia XU Kea WANG Qin-hua WANG Xiao-longa SHAN Wei-xingb c |
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| Institution: | ZHANG Weia,XU Kea,WANG Qin-hua,WANG Xiao-longa,SHAN Wei-xingb,c(a College of Life Sciences,b College of Plant Protection,c State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microRNA biotic stress regulation network GO analysis |
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