| 小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析 |
| |
| 引用本文： | 张 岗,孙燕飞,李依民.小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(8):111-118. |
| |
| 作者姓名： | 张 岗 孙燕飞 李依民 |
| |
| 作者单位： | 西北农林科技大学 植物保护学院;西北农林科技大学 植物保护学院;西北农林科技大学 植物保护学院 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（30930064，30800712）；农业部现代农业产业技术体系建设专项资金项目；高等学校学科创新引智计划项目（B07049）；国家“十一五”支撑计划项目（2006BAD08A05） |
| |
| 摘 要： | 【目的】克隆条锈菌诱导的小麦过敏性反应(Hypersensitive induced reaction,HIR)基因TaHIR4,分析其编码蛋白的结构、进化与功能。【方法】采用电子克隆、RT-PCR技术,从条锈菌侵染的小麦中,分离过敏性诱导基因TaHIR4,并对其进行克隆和序列分析;利用InterProScan、TMpred、SignalP 3.0、PSORT等在线分析工具,预测TaHIR4蛋白的保守结构域、跨膜结构、信号肽、细胞定位等特征;采用DNASTAR软件分别进行氨基酸序列同源性比对和进化树分析。【结果】分离到小麦过敏性诱导基因,命名为TaHIR4(867bp,GenBank注册号为FJ028663),该基因编码1条由288个氨基酸组成的多肽;TaHIR4蛋白含HIR蛋白家族的保守SPFH(Stomatins,Prohibitin,Flotillins,HflK/C)、PHB(Prohibitin homologues)结构域,有4种典型的motifs(蛋白激酶、酪蛋白激酶Ⅱ、酪氨酸激酶磷酸化和N-豆蔻酰化位点),N末端的19个氨基酸序列内部存在跨膜信号肽结构,可能属于分泌蛋白;TaHIR4与HvHIR4蛋白的亲缘关系最近,同源性最高(98%),其次为OsHIR4,同源性为91%。【结论】分离到1个条锈菌诱导的小麦HIR基因TaHIR4,其编码蛋白可能属于分泌蛋白,在胞外行使功能。
|
| 关 键 词： | 小麦 条锈菌 过敏性反应 电子克隆 结构域 |
| 收稿时间： | 2010/1/26 0:00:00 |
Cloning and sequence analyses of a hypersensitive induced reaction gene TaHIR4 in wheat |
| |
| ZHANG Gang,SUN Yan-fei,LI Yi-min,DONG Yan-ling,XIA Ning,WANG Xiao-jie,HUANG Li-li,KANG Zhen-sheng.Cloning and sequence analyses of a hypersensitive induced reaction gene TaHIR4 in wheat[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(8):111-118. |
| |
| Authors: | ZHANG Gang SUN Yan-fei LI Yi-min DONG Yan-ling XIA Ning WANG Xiao-jie HUANG Li-li KANG Zhen-sheng |
| |
| Institution: | 1,2(1 College of Plant Protection,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 Shaanxi Provincial Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | wheat stripe rust fungus hypersensitive response in silico cloning domain |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《西北农林科技大学学报(社会科学版)》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西北农林科技大学学报(社会科学版)》下载免费的PDF全文 |
|
