| 小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 吴 宽,颜永杰,李 蓓.小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(6):176-180. |
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| 作者姓名： | 吴 宽 颜永杰 李 蓓 |
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| 作者单位： | 西北大学 信息科学与技术学院;西北大学 生命科学学院;西北农林科技大学 植物保护学院 |
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| 基金项目： | 国家大学生创新性实验计划项目（091069702）；国家自然科学基金项目（30970133） |
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| 摘 要： | 【目的】将生物信息学方法应用于小麦蓝矮病植原体(WBD)的分类研究,确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。【方法】应用植原体核糖体蛋白(rp)基因通用引物对rpF1/rpR1,对WBD进行PCR扩增并得到特异片段,对特异片段进行测定及同源性分析。【结果】序列测定结果表明,WBDrp基因片段长1 240 bp,包含部分rps19基因和全部的rpl22和rps3基因,且后2个基因为重叠基因,分别编码129和252个氨基酸,rpl22和rps3蛋白的等电点分别为12.605和11.755。【结论】WBD与16SrⅠ-C亚组中三叶草绿变病(Clover phyllody)的KVE、KVG、CPh株系亲缘关系最近,核苷酸同源性依次为99.7%,99.6%和99.0%,WBD与KVE株系的rpl22和rps3基因编码的氨基酸同源性分别为100%和98%,因此将小麦蓝矮病植原体划归到16SrⅠ-C亚组。
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| 关 键 词： | 小麦蓝矮病植原体 生物信息学 核糖体蛋白 序列分析 |
| 收稿时间： | 2009/12/9 0:00:00 |
Bioinformatics analysis of ribosomal protein rpl22 and rps3 gene of wheat blue dwarf phytoplasma |
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| WU Kuan,a,YAN Yong-jie,b,LI Bei,WU Ke-ke.Bioinformatics analysis of ribosomal protein rpl22 and rps3 gene of wheat blue dwarf phytoplasma[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(6):176-180. |
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| Authors: | WU Kuan a YAN Yong-jie b LI Bei WU Ke-ke |
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| Institution: | 1 a.School of Information Science and Technology,b.College of Life Sciences,Northwest University,Xi’an,Shaanxi 710069,China;2 College of Plant Protection,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | wheat blue dwarf phytoplasma bioinformatics ribosomal protein sequence analysis |
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