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细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析
引用本文:刘田莉,孟庆玲,乔 军,等.细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(3):17-22.
作者姓名:刘田莉  孟庆玲  乔 军  
作者单位:石河子大学 动物科技学院,石河子大学 动物科技学院,石河子大学 动物科技学院
基金项目:国家公益性(农业)行业专项(201303037);国家国际科技合作项目(2014DFR31310);新疆自治区研究生科研创新项目(XJGRI2014059)
摘    要:【目的】克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4(Reticulon-4,RTN4)抗原基因,对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏,提取Eg头节总RNA为模板,对RTN4基因进行RT-PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Eg RTN4cDNA全长654bp,编码217个氨基酸,蛋白质分子质量为25.3ku,等电点为8.83。编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点。经生物信息学软件预测,RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域;含有2个高度疏水区,2个跨膜区,膜外区分别位于第1-47位和第171-217位。【结论】成功克隆了Eg RTN4基因,预测了其编码蛋白抗原的结构和表位。

关 键 词:细粒棘球蚴  抗原基因  基因克隆  生物信息学分析
收稿时间:8/7/2014 12:00:00 AM

Cloning and sequence analysis of RTN4 gene of Echinococcus granulosus
LIU Tian-li,MENG Qing-ling and QIAO Jun,et al.Cloning and sequence analysis of RTN4 gene of Echinococcus granulosus[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2016,44(3):17-22.
Authors:LIU Tian-li  MENG Qing-ling and QIAO Jun  
Abstract:
Keywords:Echinococcus granulosus  antigen gene  gene cloning  bioinformatics analysis
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