| 甘南牦牛CYGB基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 娄延岳,杜晓华,罗玉柱,等.甘南牦牛CYGB基因的克隆及生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2015,43(4):1-6,11. |
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| 作者姓名： | 娄延岳 杜晓华 罗玉柱 等 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学 生命科学技术学院；甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃农业大学 动物医学院；甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃省草食动物生物技术重点实验室 |
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| 基金项目： | 甘肃省自然科学基金项目（1107RJZA148）；甘肃省教育厅研究生导师项目（1102-04）；甘肃省高等学校基本科研业务费资助项目（2013）；甘肃农业大学科技创新基金项目（GAU-CX1037，GAU-CX1038） |
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| 摘 要： | 【目的】探讨甘南牦牛CYGB基因的分子结构特征及生理功能。【方法】提取甘南牦牛血样基因组DNA,以其为模板PCR分段扩增后拼接得到CYGB基因,测序后进行生物信息学分析。【结果】克隆出甘南牦牛CYGB基因,其长度为8 484bp,含有4个外显子和3个内含子,外显子长度分别为143,232,164和34bp,内含子长度分别为5 175,280和2 379bp,可编码190个氨基酸残基,氨基酸编码存在明显的密码子偏倚现象。与普通牛相比较,甘南牦牛CYGB基因存在73处核苷酸变异位点,其中2处发生在外显子2区域,氨基酸序列未发生改变;71处发生在内含子区域。甘南牦牛CYGB拥有"three-over-three"类型的螺旋"三明治"折叠结构。系统发育树分析表明,甘南牦牛CYGB与黄牛、绵羊等物种之间存在较高的同源性。【结论】成功克隆了甘南牦牛CYGB基因,为进一步研究牦牛CYGB的遗传特性和生理机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 甘南牦牛 胞红蛋白 基因 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2013/11/23 0:00:00 |
Cloning and bioinformatics analysis of CYGB gene of Gannan yak |
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| LOU Yan-yue,DU Xiao-hua and LUO Yu-zhu,et al.Cloning and bioinformatics analysis of CYGB gene of Gannan yak[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2015,43(4):1-6,11. |
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| Authors: | LOU Yan-yue DU Xiao-hua and LUO Yu-zhu |
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| Institution: | LOU Yan-yue;DU Xiao-hua;LUO Yu-zhu;LIU Xia;ZHANG Lei;College of Life Science and Technology,Gansu Agricultural University;Gansu Key Laboratory of Herbivorous Animal Biotechnology;College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University;Department of Animal Science,Henan Vocational College of Agriculture; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gannan yak cytoglobin gene bioinformatics |
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