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中国南方部分黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传变异与分类分析
引用本文:周 艳,陈 宏,贾善刚.中国南方部分黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传变异与分类分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2008,36(5):7-11.
作者姓名:周 艳  陈 宏  贾善刚
作者单位:1. 西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌,712100
2. 西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌,712100;徐州师范大学,细胞与分子生物学研究所,江苏,徐州,221116
基金项目:国家自然科学基金 , 西北农林科技大学校科研和教改项目
摘    要:【目的】检测中国黄牛品种的遗传多样性和遗传亲缘关系。【方法】扩增、测序并分析了8个南方黄牛品种(川南牛、务川牛、温岭牛、隆林牛、湘西牛、郧巴牛、昭通牛、锦江牛)共计40个个体的线粒体D-loop区(mtDNAD-loop)全序列。【结果】共检测到56个变异位点,17个单倍型,平均核苷酸差异(K)为20.364,核苷酸多样度(π)为2.25%,单倍型多样度(Hd)为0.750±0.074;4种碱基A、T、C、G的频率分别为33.2%,28.2%,25.1%和13.5%;56处多态位点中,转换49处(占多态位点87.5%),颠换4处(占7.14%),缺失/插入3处(占5.36%);在样本数量超过3的群体中,锦江牛和昭通牛分别显示出最贫乏和最丰富的遗传多样性;构建的NJ进化树表明,云南昭通牛与其他7个品种的亲缘关系最远。【结论】普通牛较瘤牛具有丰富的遗传多样性,支持普通牛的多地区起源说;云南昭通牛含有不同于印度瘤牛的瘤牛血统,从分子水平上支持云南是潜在的瘤牛起源驯化中心。

关 键 词:黄牛  线粒体D-loop区  遗传多样性
收稿时间:2007/5/31 0:00:00

The analysis of genetic variation of mtDNA D-loop region and phylogenesis on some southern Chinese cattle breeds
ZHOU Yan,CHEN Hong,JIA Shan-gang,LEI Chu-zhao.The analysis of genetic variation of mtDNA D-loop region and phylogenesis on some southern Chinese cattle breeds[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2008,36(5):7-11.
Authors:ZHOU Yan  CHEN Hong  JIA Shan-gang  LEI Chu-zhao
Institution:1(1 College of Animal Science and Technology,Northwest A & F University,Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 Institute of Cellular and Molecular Biology,Xuzhou Normal University,Xuzhou,Jiangsu 221116,China)
Abstract:
Keywords:Chinese native cattle  mitochondrial D-loop  genetic diversity
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