| 小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中编码分泌蛋白的序列预测 |
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| 引用本文： | 薛晓丹,屈志鹏,王晓杰.小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中编码分泌蛋白的序列预测[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2009,37(2):105-111. |
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| 作者姓名： | 薛晓丹 屈志鹏 王晓杰 |
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| 作者单位： | 薛晓丹,屈志鹏,王晓杰,张永红,李国田,黄丽丽,XUE Xiao-dan,QU Zhi-peng,WANG Xiao-jie,ZHANG Yong-hong,LI Guo-tian,HUANG Li-li(西北农林科技大学,植保学院,陕西,杨凌,712100);康振生,KANG Zhen-sheng(西北农林科技大学,植保学院,陕西,杨凌,712100;陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌,712100)
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划(973计划)，国家重点基础研究发展规划(973计划)，农业部行业计划项目，教育部长江学者和创新团队发展计划，高等学校学科创新引智计划项目 |
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| 摘 要： | 【目的】植物与病原菌互作过程中,涉及许多可以与植物受体蛋白相互识别、引发植物防卫反应的病原菌激发子或其他致病因子,其中多数为分泌蛋白,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。【方法】通过SignalP v3.0、TMHMM v2.0、TargetP v1.1、Protcomp v6.0 4个软件,对陕西省农业分子生物学重点实验室构建的小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中854条EST序列进行分泌蛋白预测。【结果】得到具有可溶性分泌信号肽的蛋白编码序列33条,占测定序列的3.86%,其中最小长度为196 bp,最大为1 096 bp,分泌信号肽切割位点基本位于15~42个氨基酸,平均为37个氨基酸。【结论】预测得到的分泌蛋白编码序列,可以作为小麦与条锈菌互作过程中的激发子和致病因子备选基因来进一步研究。
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| 关 键 词： | 小麦条锈菌 分泌蛋白 信号肽 预测软件 |
| 收稿时间： | 2008/4/11 0:00:00 |
Prediction secreted proteins from cDNA library of Puccinia striiformis f. sp. tritici |
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| XUE Xiao-dan,QU Zhi-peng,WANG Xiao-jie,ZHANG Yong-hong,LI Guo-tian,HUANG Li-li,KANG Zhen-sheng.Prediction secreted proteins from cDNA library of Puccinia striiformis f. sp. tritici[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2009,37(2):105-111. |
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| Authors: | XUE Xiao-dan QU Zhi-peng WANG Xiao-jie ZHANG Yong-hong LI Guo-tian HUANG Li-li KANG Zhen-sheng |
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| Institution: | 1,2(1 College of Plant Protection,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 Key Lab of Agricultural Molecular Biology,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Puccinia striiformis f sp tritici secreted protein signal peptide prediction algorithm |
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