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吉林地区高致病性PRRSV JL-04/12株的 分离鉴定与全基因组测序
引用本文:王凤雪,郭 利,温永俊.吉林地区高致病性PRRSV JL-04/12株的 分离鉴定与全基因组测序[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2013,41(4):37-44.
作者姓名:王凤雪  郭 利  温永俊
作者单位:中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室
基金项目:国家“863”项目“新型重大动物疫病疫苗与诊断试剂创制及生产工艺创新”(2011AA10A213)
摘    要:【目的】确定吉林省某疑似高致病性PRRS猪场的病原,研究其基因特性。【方法】采集疑似感染高致病性PRRSV病猪的脏器组织,处理后接种MARC-145细胞,观察细胞病变,分离PRRSV;应用RT-PCR方法检测和确定分离毒株的基因型,采用间接免疫荧光、电镜观察和全基因组测序检测分离的病毒。【结果】分离毒株为北美洲型PRRSV,命名为JL-04/12,其基因组全长为15 320bp(不包括PolyA),可使MARC-145细胞产生典型的细胞病变。序列比对结果表明:JL-04/12株与经典毒株VR-2332和CH-1a的核苷酸同源性分别为89.5%和94.9%;与高致病性毒株JXA1、HUN4的核苷酸同源性为99.1%。分离毒株JL-04/12编码的2个非结构蛋白和GP2~GP4的氨基酸序列与HUN4株同源性较高,在97.2%~99.3%,而JL-04/12编码的GP5的氨基酸序列与JXA1株同源性较高,为98.5%;JL-04/12编码的GP6和N蛋白的氨基酸序列与高致病性PRRSV毒株JXA1和HUN4的同源性均为100%。PRRSV JL-04/12株的Nsp2不连续缺失30个氨基酸,与高致病性PRRSV毒株JXA1和HUN4的同源性最高,均为97.8%,判定该分离株为变异的高致病性PRRSV。【结论】从吉林省分离到1株高致病性PRRSV,说明高致病性PRRS变异病毒在吉林省仍然存在。

关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒  分离鉴定  全基因组测序
收稿时间:2012/7/12 0:00:00

Isolation,identification and sequencing of PRRSV JL-04/12 strain with high pathogenicity from Jilin,China
WANG Feng-xue,GUO Li,WEN Yong-jun,SONG Ni,YANG Yan-ling,ZHANG Shu-qin,TAN Bin,WU Hua.Isolation,identification and sequencing of PRRSV JL-04/12 strain with high pathogenicity from Jilin,China[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2013,41(4):37-44.
Authors:WANG Feng-xue  GUO Li  WEN Yong-jun  SONG Ni  YANG Yan-ling  ZHANG Shu-qin  TAN Bin  WU Hua
Institution:(State Key Laboratory for Molecular Biology of Special Economic Animals,Institute of Special Economic Animal and Plant Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Changchun,Jilin 130112,China)
Abstract:
Keywords:porcine reproductive and respiratory syndrome virus  isolation and identification  genome sequencing
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