| 绵羊脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP)的变异研究 |
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| 引用本文： | 徐蕾,闫伟,胡江,刘秀,李少斌,王继卿,罗玉柱.绵羊脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP)的变异研究[J].甘肃农业大学学报,2016(1):29-34. |
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| 作者姓名： | 徐蕾 闫伟 胡江 刘秀 李少斌 王继卿 罗玉柱 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃省牛羊基因改良工程实验室,甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃农业大学盛彤笙科技创新基金(GSAU-STS-1421)，甘肃省创新研究群体计划(1210RJIA005)，国家科技支撑计划(2012BAD13B05)，国家国际科技合作专项(2011DFG33310)，甘肃省国际科技合作专项(1304WCGA178) |
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| 摘 要： | 【目的】明确绵羊A-FABP(adipocyte fatty-acid binding protein,A-FABP)基因的变异和单倍型特征.【方法】基于Ensemble数据库中绵羊A-FABP基因全序列,对7个绵羊品种共20个样本的A-FABP基因全序列进行测序分析.【结果】PCR扩增获得绵羊A-FABP基因全长6474bp,A、T、G、C 4种碱基的比例分别为31.48%、33.02%、17.21%和18.29%,A+T平均含量为64.50%,G+C平均含量为35.50%;共发现48处单碱基变异位点和2处微卫星位点M1((TG)n)和M2((TA)n),单一变异位点、2核苷酸变异位点和3核苷酸变异位点比例分别为28.85%、40.4%和0.02%;共发现转换、颠换、插入和缺失4种变异类型,其占变异位点总数的比例分别为45.83%、31.25%、2.08%及20.83%;共发现19种单倍型,单倍型多样度为0.995.【结论】A-FABP基因19个单倍型序列的NJ树分化为2个聚类簇,表明A-FABP基因单倍型最初由2个主要单倍型衍化形成.
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| 关 键 词： | 绵羊 A-FABP基因 变异 |
Variations on ovine adipocyte fatty-acid binding protein (A-FABP) gene |
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