| '合作猪'TDRP基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 蒋应弟,滚双宝,袁慧芳,曾国敏,高景波.'合作猪'TDRP基因的克隆及生物信息学分析[J].甘肃农业大学学报,2017,52(4). |
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| 作者姓名： | 蒋应弟 滚双宝 袁慧芳 曾国敏 高景波 |
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| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州,730070;2. 兰州大学第一医院,甘肃 兰州,730000;3. 甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州,730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省科技重大专项"高繁殖力猪新品系选育研究" |
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| 摘 要： | 目的]丰富猪TDRP1基因研究的基础数据.方法]以猪NM_001198925序列为参考,设计特异性引物,通过克隆测序获得'合作猪'TDRP1基因完整CDS序列,并进行生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR方法检测TDRP1基因在不同组织中的表达特性.结果]获得了TDRP1基因完整的CDS序列(GenBank登录号:KU743254),共684bp,其编码186个氨基酸多肽.与参考序列相比,在编码区第33、348位点处发生了同义突变(C→G、C→T).TDRP1基因分子式为C897H1421N259O287S2,理论等电点(PI)为5.86,不稳定系数为62.66,疏水指数为64.03,平均亲水性为-0.939,属不稳定可溶性酸性蛋白质.二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,属混合类蛋白质.亚细胞定位结果显示,TDRP1编码的蛋白质在遗传物质复制和转录、翻译过程中发挥功能的可能性分别为26.3%、14.3%,明显高于发挥其它功能的可能性.mRNA表达分析表明,TDRP1基因在垂体和睾丸中高表达,肺、肾、小脑、卵巢中度表达,肝、脾、大脑、胃、小肠中低表达,心脏组织中不表达.结论]成功克隆了'合作猪'TDRP1基因的完整CDS区序列,并发现了2个SNP位点;多组织转录表达分析表明TDRP1在垂体和睾丸中表达较高,可为深入研究TDRP1基因的功能提供参考.
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| 关 键 词： | 合作猪 TDRP1基因 精子 生物信息学分析 |
Cloning and bioinformatics analysis of TDRP1 gene in Hezuo pig |
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| JIANG Ying-di,GUN Shuang-bao,YUAN Hui-fang,ZENG Guo-min,GAO Jing-bo.Cloning and bioinformatics analysis of TDRP1 gene in Hezuo pig[J].Journal of Gansu Agricultural University,2017,52(4). |
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| Authors: | JIANG Ying-di GUN Shuang-bao YUAN Hui-fang ZENG Guo-min GAO Jing-bo |
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