| 马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析 |
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| 引用本文： | 李世风,张宁,刘柏林,杜宏辉,司怀军,王蒂.马铃薯microRNA及其靶基因的预测与功能分析[J].甘肃农业大学学报,2010,45(6). |
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| 作者姓名： | 李世风 张宁 刘柏林 杜宏辉 司怀军 王蒂 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家"863"项目 |
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| 摘 要： | 根据miRNA序列在植物中的高度保守性,通过拟南芥、水稻、玉米等植物中已知的miRNA序列与马铃薯的表达序列标签(EST)、基因组测序序列(GSS)以及核酸数据库中的序列进行比对,最后通过在线比对软件blastx去掉编码序列,共发现32条新的miRNAs,并且这32条前体均可折叠形成miRNA家族的标准二级结构;利用新发现的马铃薯miRNAs通过在线软件miRU和miRU2与编码蛋白的数据库比对,预测到了100个靶基因,分别编码与马铃薯生长发育、新陈代谢、信号转导、转录调节、胁迫反应等相关的蛋白.
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| 关 键 词： | 马铃薯 microRNA 靶基因 功能 |
Prediction and function analysis of microRNA and target genes in potato |
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| LI Shi-feng,ZHANG Ning,LIU Bo-lin,DU Hong-hui,SI Huai-jun,WANG Di.Prediction and function analysis of microRNA and target genes in potato[J].Journal of Gansu Agricultural University,2010,45(6). |
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| Authors: | LI Shi-feng ZHANG Ning LIU Bo-lin DU Hong-hui SI Huai-jun WANG Di |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | potato microRNA target gene function |
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